More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0966 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  100 
 
 
746 aa  1512  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  46.04 
 
 
806 aa  663  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  45.57 
 
 
823 aa  640  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.11 
 
 
558 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41 
 
 
571 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.73 
 
 
568 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.24 
 
 
568 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.55 
 
 
568 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.37 
 
 
568 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.14 
 
 
568 aa  426  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.73 
 
 
553 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.93 
 
 
568 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
555 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.56 
 
 
559 aa  422  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.11 
 
 
568 aa  417  1e-115  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.79 
 
 
563 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.45 
 
 
553 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.78 
 
 
871 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.96 
 
 
568 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
553 aa  409  1e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.72 
 
 
568 aa  406  1e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.94 
 
 
566 aa  409  1e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.56 
 
 
558 aa  408  1e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.72 
 
 
568 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
565 aa  405  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.26 
 
 
568 aa  400  1e-110  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  38.35 
 
 
577 aa  400  1e-110  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.03 
 
 
520 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
787 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.14 
 
 
573 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  39.61 
 
 
554 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.23 
 
 
520 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  44.06 
 
 
521 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
563 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
561 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.58 
 
 
564 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.54 
 
 
571 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44.05 
 
 
514 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  38.98 
 
 
553 aa  392  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
885 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.47 
 
 
569 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  38.66 
 
 
563 aa  389  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.23 
 
 
557 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.61 
 
 
569 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.79 
 
 
569 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  41.73 
 
 
577 aa  389  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.96 
 
 
570 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40 
 
 
569 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  37.66 
 
 
562 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.47 
 
 
569 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  38.65 
 
 
552 aa  384  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.6 
 
 
569 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.23 
 
 
571 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.29 
 
 
569 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  40.6 
 
 
569 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.25 
 
 
569 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  36.99 
 
 
564 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  37.52 
 
 
563 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.25 
 
 
568 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  1.24471e-05 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
569 aa  382  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.04 
 
 
571 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  46.21 
 
 
482 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.44 
 
 
568 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  39.37 
 
 
587 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.76 
 
 
569 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.32 
 
 
561 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.46 
 
 
566 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.82 
 
 
568 aa  379  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.08 
 
 
570 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.05 
 
 
570 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.87 
 
 
570 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.44 
 
 
599 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.15 
 
 
557 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.72 
 
 
570 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.05 
 
 
570 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.81945e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.27 
 
 
599 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  44.29 
 
 
486 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  42.36 
 
 
521 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  42.36 
 
 
521 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.04 
 
 
603 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  42.57 
 
 
521 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.27 
 
 
599 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  37.5 
 
 
888 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  42.68 
 
 
514 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  38.6 
 
 
568 aa  376  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  42.36 
 
 
521 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  40.36 
 
 
560 aa  373  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  42.45 
 
 
514 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  46.05 
 
 
494 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  39.08 
 
 
547 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.22 
 
 
520 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.11826e-14 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  37.85 
 
 
573 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  41.96 
 
 
501 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  42.74 
 
 
562 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  46.85 
 
 
491 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  42.57 
 
 
521 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  40.1 
 
 
571 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  43.17 
 
 
500 aa  370  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.27 
 
 
549 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  38.05 
 
 
572 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>