More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2922 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  68.27 
 
 		 881 aa  1140    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 883 aa  1761    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.92 
 
 		 545 aa  662    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  74.52 
 
 		 884 aa  1209    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  61.74 
 
 		 545 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  64.71 
 
 		 880 aa  1073    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.41 
 
 		 884 aa  1207    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  41.84 
 
 		 1145 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  42.23 
 
 		 1141 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 		 1146 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1146 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 1146 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  41.65 
 
 		 1146 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1146 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 1145 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  43.72 
 
 		 1150 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  39.81 
 
 		 1142 aa  399  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1146 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 1146 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1140 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1159 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  38.81 
 
 		 1148 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 1140 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  43.32 
 
 		 1161 aa  393  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 1152 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 1172 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  43.05 
 
 		 1159 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 		 1140 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  37.21 
 
 		 1177 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  37.75 
 
 		 1055 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 1159 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 		 1156 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1159 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  42.67 
 
 		 1159 aa  376  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  42.34 
 
 		 1157 aa  373  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 1158 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 1159 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  37.18 
 
 		 1147 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 1138 aa  357  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.07 
 
 		 1158 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 1111 aa  354  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1172 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1152 aa  340  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1175 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  35.22 
 
 		 1147 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.57 
 
 		 1179 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 1161 aa  337  7e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1168 aa  335  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 		 1172 aa  334  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1166 aa  334  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.46 
 
 		 1168 aa  332  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.14 
 
 		 1156 aa  330  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1177 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 1145 aa  328  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1174 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1168 aa  324  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  42.7 
 
 		 1006 aa  320  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 1169 aa  320  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 1163 aa  320  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1185 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  39.81 
 
 		 1169 aa  318  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1169 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1171 aa  313  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  35.99 
 
 		 1174 aa  312  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 		 1116 aa  313  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1167 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.42 
 
 		 1169 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 1169 aa  310  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1168 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1168 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  50.74 
 
 		 586 aa  306  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  49.28 
 
 		 588 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  49.13 
 
 		 586 aa  303  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  48.22 
 
 		 585 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  46.07 
 
 		 585 aa  301  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 733 aa  295  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 733 aa  295  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 1169 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 		 585 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.24 
 
 		 585 aa  287  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 		 585 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1170 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 733 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  47.7 
 
 		 585 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 1316 aa  278  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 567 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  36.99 
 
 		 676 aa  277  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.73 
 
 		 1184 aa  277  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 635 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 		 556 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 744 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 655 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  33.77 
 
 		 842 aa  261  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 		 554 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 591 aa  258  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  38.41 
 
 		 881 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  38.36 
 
 		 868 aa  253  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  35.02 
 
 		 747 aa  250  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.53 
 
 		 854 aa  250  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>