More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0293 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 87 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  75 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  69.51 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  69.88 
 
 		 90 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 87 aa  120  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  64.29 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  64.29 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  58.14 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  65.75 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  56.98 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  56.98 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  63.01 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  63.01 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  63.01 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  53.97 
 
 		 768 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 216 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  49.21 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.15 
 
 		 216 aa  63.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 245 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 222 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 246 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  52.54 
 
 		 231 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 229 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 212 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 250 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 254 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 254 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  43.75 
 
 		 222 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  53.45 
 
 		 418 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  51.72 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 219 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  42.03 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  48.21 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 255 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 535 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 221 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 220 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  43.33 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  49.12 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  48.44 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>