More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2334 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  100 
 
 		 614 aa  1248    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.73 
 
 		 607 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3494  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.18 
 
 		 627 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000299529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4081  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.83 
 
 		 612 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3994  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.75 
 
 		 612 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.460388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4505  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.44 
 
 		 610 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000203589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3050  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.26 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.71 
 
 		 613 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0910  capsular polysaccharide biosynthesis protein  50.98 
 
 		 614 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0128  hypothetical protein  45.81 
 
 		 635 aa  559  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4432  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.67 
 
 		 626 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4411  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.79 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2347  polysaccharide biosynthesis protein CapD  46.55 
 
 		 616 aa  542  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.866725 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1272  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.1 
 
 		 656 aa  533  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1338  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.61 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0399433 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05820  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  45.23 
 
 		 613 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0718639  hitchhiker  0.00116651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5448  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  45.57 
 
 		 604 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5395  caspsular polysaccharide biosynthesis protein  45.23 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1009  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.09 
 
 		 635 aa  514  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000685319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1633  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.19 
 
 		 647 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5070  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.27 
 
 		 612 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.57 
 
 		 651 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3403  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.12 
 
 		 609 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1536  polysaccharide biosynthesis protein  42.83 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.68 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2582  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.09 
 
 		 647 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0903  polysaccharide biosynthesis protein  42.28 
 
 		 615 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.999651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1871  putative epimerase/dehydratase polysaccharide-related biosynthesis protein  44.34 
 
 		 614 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0039  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.21 
 
 		 620 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2864  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.2 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1513  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.73 
 
 		 638 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0299792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0573  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.54 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.06 
 
 		 619 aa  481  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1997  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.31 
 
 		 650 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.521686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3268  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.38 
 
 		 629 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2767  polysaccharide synthase family protein  43.16 
 
 		 637 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3127  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.16 
 
 		 637 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1976  polysaccharide synthase family protein  43.16 
 
 		 637 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3090  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.16 
 
 		 637 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3150  polysaccharide biosynthesis protein  43.16 
 
 		 637 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3984  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.38 
 
 		 627 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1483  capsular polysaccharide biosynthesis  42.88 
 
 		 656 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1838  polysaccharide synthase family protein  43.16 
 
 		 637 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0937  polysaccharide synthase family protein  43.16 
 
 		 637 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0776  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.2 
 
 		 627 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.905737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0902  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.28 
 
 		 625 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.97 
 
 		 617 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.73 
 
 		 628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0857  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.8 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0408  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.8 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0143  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.46 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0887  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.8 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.46 
 
 		 607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  42.91 
 
 		 649 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1028  hypothetical protein  41.89 
 
 		 621 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0995  hypothetical protein  42.05 
 
 		 621 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1360  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.83 
 
 		 643 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1211  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.92 
 
 		 605 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3780  putative epimerase/dehydratase polysaccharide- related biosynthesis protein  41.11 
 
 		 625 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00473075  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1244  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.92 
 
 		 605 aa  464  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0765  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.85 
 
 		 630 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3654  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.96 
 
 		 656 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.772925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2289  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.76 
 
 		 629 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1278  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.41 
 
 		 637 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000704719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4167  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.97 
 
 		 648 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0484  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.8 
 
 		 648 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3126  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.11 
 
 		 633 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0301  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.33 
 
 		 623 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2281  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.02 
 
 		 630 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.43 
 
 		 652 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0631  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.69 
 
 		 670 aa  445  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16980  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  49.57 
 
 		 487 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.14 
 
 		 680 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0086  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.65 
 
 		 645 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0802  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.64 
 
 		 676 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.97 
 
 		 655 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3656  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.3 
 
 		 652 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.45 
 
 		 647 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.75 
 
 		 646 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.44 
 
 		 652 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0594  polysaccharide biosynthesis protein  39.6 
 
 		 646 aa  422  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.29 
 
 		 594 aa  420  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2244  polysaccharide biosynthesis protein  40.92 
 
 		 644 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.36548  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.22 
 
 		 682 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase transmembrane protein  40.61 
 
 		 665 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3171  polysaccharide biosynthesis protein  40.39 
 
 		 646 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1486  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.58 
 
 		 646 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0306155  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4862  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.31 
 
 		 600 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.428479  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3983  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.99 
 
 		 643 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2645  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.72 
 
 		 649 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2876  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.72 
 
 		 646 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2723  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.59 
 
 		 649 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3816  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.27 
 
 		 645 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1131  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.21 
 
 		 671 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00726608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1414  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.56 
 
 		 669 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.987327  normal  0.0491926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0609  polysaccharide biosynthesis protein  38.82 
 
 		 642 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1842  polysaccharide biosynthesis protein CapD type  37.61 
 
 		 684 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0713  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.17 
 
 		 641 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2527  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.65 
 
 		 646 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.64 
 
 		 647 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>