More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2624 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  54.01 
 
 
248 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  55.65 
 
 
251 aa  275  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.38 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.38 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.25 
 
 
249 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.77 
 
 
259 aa  262  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.95 
 
 
252 aa  261  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.04 
 
 
258 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.88 
 
 
252 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.52 
 
 
257 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.8 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
258 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
258 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
258 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
258 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
258 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
258 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.54 
 
 
249 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
258 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
255 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.26 
 
 
257 aa  248  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
249 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
256 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
256 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.71 
 
 
249 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
228 aa  246  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
258 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
241 aa  246  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
257 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.7 
 
 
237 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
258 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
258 aa  245  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
263 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.04 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
257 aa  244  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.7 
 
 
249 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
254 aa  244  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
254 aa  243  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.58 
 
 
251 aa  242  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.54 
 
 
270 aa  241  6e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.88 
 
 
248 aa  241  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
256 aa  240  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
256 aa  240  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.31 
 
 
246 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.93 
 
 
267 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.84 
 
 
249 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
252 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.32 
 
 
251 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
247 aa  238  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
257 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
257 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  45.89 
 
 
251 aa  237  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
259 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
246 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
259 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
246 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 
243 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
246 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
251 aa  236  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
249 aa  236  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
266 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.51 
 
 
267 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.35 
 
 
267 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.7 
 
 
241 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.09 
 
 
247 aa  235  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
252 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
256 aa  235  6e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
272 aa  234  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.32 
 
 
267 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
236 aa  234  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  45.89 
 
 
254 aa  234  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  47.84 
 
 
246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.19 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 
255 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
251 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.05 
 
 
237 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
237 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.93 
 
 
258 aa  232  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 
261 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
245 aa  231  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
276 aa  230  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
252 aa  230  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>