More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2561 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  303  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  32.82 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.3 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  35.78 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  35.78 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  37.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  37.78 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  29.01 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  37.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  28.78 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  37.78 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  37.78 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.34 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  30.28 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  31.37 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  28.68 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  34.95 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.13 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>