More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0621 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
311 aa  630  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.87759e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  77.92 
 
 
322 aa  495  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.61 
 
 
322 aa  431  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  64.4 
 
 
324 aa  405  1e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  62.3 
 
 
323 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.49 
 
 
321 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1628  RND family efflux transporter MFP subunit  48.57 
 
 
326 aa  282  5e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  26.87 
 
 
357 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 
416 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  25.84 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 
428 aa  96.3  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  25.23 
 
 
353 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 
353 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 
521 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 
409 aa  95.1  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  25.53 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  25.6 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 
374 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.16 
 
 
663 aa  92.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  25.84 
 
 
353 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  30.47 
 
 
517 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 
549 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  29.08 
 
 
366 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 
489 aa  86.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  9.75793e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.16 
 
 
505 aa  85.5  1e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  26.85 
 
 
394 aa  85.5  1e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.14 
 
 
517 aa  85.1  2e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 
340 aa  84.7  2e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.09 
 
 
500 aa  84  3e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.45 
 
 
504 aa  83.6  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.98 
 
 
430 aa  83.6  4e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  25.31 
 
 
392 aa  83.2  5e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.95 
 
 
432 aa  82.4  8e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.09 
 
 
608 aa  82.4  9e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  25.56 
 
 
388 aa  81.3  2e-14  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 
455 aa  80.9  3e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 
390 aa  80.5  3e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  28.95 
 
 
343 aa  80.5  4e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  23.76 
 
 
356 aa  80.1  5e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 
407 aa  79.7  6e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  29.38 
 
 
400 aa  79.3  7e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  25.07 
 
 
403 aa  78.6  1e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.67095e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 
430 aa  78.2  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  28.79 
 
 
338 aa  77.4  3e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  30.5 
 
 
449 aa  77.4  3e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.84 
 
 
430 aa  77  3e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 
432 aa  77  3e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  24.49 
 
 
429 aa  77  4e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 
448 aa  77  4e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  29.47 
 
 
390 aa  75.9  9e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  34.81 
 
 
430 aa  75.9  9e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  28.53 
 
 
338 aa  75.9  9e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  30.5 
 
 
424 aa  75.5  1e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2284  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 
323 aa  75.5  1e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.489118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  32.35 
 
 
417 aa  75.5  1e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 
384 aa  74.7  2e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  25.25 
 
 
417 aa  74.7  2e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 
419 aa  75.1  2e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 
395 aa  74.7  2e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  3.59698e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.78 
 
 
405 aa  73.9  3e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.67489e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 
429 aa  73.6  4e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1169  membrane-fusion protein  25 
 
 
377 aa  73.2  5e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.05 
 
 
451 aa  72.8  6e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  28.34 
 
 
607 aa  72.4  1e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
417 aa  72  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  36.15 
 
 
442 aa  72  1e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  35.04 
 
 
493 aa  71.6  2e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1576  hypothetical protein  24.55 
 
 
538 aa  71.2  2e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  4.69738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 
621 aa  70.9  3e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
335 aa  70.5  4e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 
363 aa  70.1  5e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
335 aa  69.3  7e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.43 
 
 
419 aa  69.3  7e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05818e-10 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.19 
 
 
335 aa  69.3  7e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 
404 aa  68.9  9e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  29.53 
 
 
421 aa  68.6  1e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  26.05 
 
 
398 aa  68.6  1e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.43 
 
 
419 aa  68.6  1e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  30.29 
 
 
598 aa  68.6  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  29.52 
 
 
225 aa  68.6  1e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.31 
 
 
414 aa  68.9  1e-10  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.89 
 
 
390 aa  68.6  1e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30 
 
 
329 aa  68.2  2e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  31.65 
 
 
500 aa  68.2  2e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  32.09 
 
 
433 aa  67.8  2e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  25.49 
 
 
403 aa  68.2  2e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  26.48 
 
 
446 aa  67.8  2e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  31.35 
 
 
621 aa  68.2  2e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  28.89 
 
 
533 aa  67.4  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.87 
 
 
586 aa  67.4  3e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 
487 aa  67.4  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  28.11 
 
 
414 aa  67.4  3e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 
487 aa  67.4  3e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1470  membrane-fusion protein  29.09 
 
 
394 aa  67  4e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.9 
 
 
362 aa  67  4e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 
356 aa  66.6  5e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  34.11 
 
 
489 aa  66.6  5e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 
641 aa  66.6  5e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>