More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1696 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 459 aa  922    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  50.88 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  51.84 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  49.78 
 
 		 453 aa  435  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  50.8 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  39.46 
 
 		 453 aa  316  7e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  38.02 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 485 aa  187  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  31.1 
 
 		 456 aa  156  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  32.21 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  31.22 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  31.08 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 		 457 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  33.82 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  33.04 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  32.86 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 395 aa  114  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 		 407 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  32.94 
 
 		 397 aa  104  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.87 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.53 
 
 		 430 aa  99.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.71 
 
 		 396 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  27.54 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1540  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 375 aa  87  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.76 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.59 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.8 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.08 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.08 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  26.5 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  26.5 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  26.5 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  26.5 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  23.99 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0060  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  24.59 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  24.59 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  24.59 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  24.79 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  24.86 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  24.59 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4041  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>