164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0458 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  65.79 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  63.16 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  63.68 
 
 		 201 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  60.53 
 
 		 202 aa  248  6e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  51.06 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  40.4 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  42.64 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  42.78 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  42.93 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  40.84 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  41.71 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  39.9 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  39.69 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  38.38 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  40.41 
 
 		 209 aa  140  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.51 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  39.27 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  41.67 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  38.34 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  38.34 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  38.02 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  38.42 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  37.89 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  37.82 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  37.7 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  36.32 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  35.29 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  35.71 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.22 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.62 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  33.86 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  29.19 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  37.02 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  30.61 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.27 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  31.53 
 
 		 303 aa  92  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  34.05 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.27 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  32.28 
 
 		 267 aa  88.2  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  35.68 
 
 		 297 aa  87.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  29 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  33.9 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  31.31 
 
 		 296 aa  85.5  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  33.33 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  32.66 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  31.25 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.73 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  34.27 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  29.35 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  25.87 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  27.32 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  29.02 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  28.49 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  27.36 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  36.57 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  33.14 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  27.6 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  32.54 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  32.54 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  27.86 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  28.11 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  31.95 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  30.99 
 
 		 249 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  28.82 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  31.61 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.85 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  29.59 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  31.66 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  30.39 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  32.54 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  27.46 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.12 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  27.13 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  29.55 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  27.01 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  30.24 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  27.84 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  28.82 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  28.26 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  28.11 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  31.4 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  25.48 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  30.32 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  30.1 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  27.31 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  23.53 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  30.2 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  25.43 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  29.41 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  28.81 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  27.43 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  29.94 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  23.88 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  27.17 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  26.59 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  23.08 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  26.21 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  25.5 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  27.94 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>