More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0911 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  100 
 
 
316 aa  620  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  63.9 
 
 
317 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  63.58 
 
 
317 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  62.62 
 
 
317 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  47.59 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  42.18 
 
 
363 aa  240  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  40.37 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 
385 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  42.13 
 
 
366 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  34.57 
 
 
220 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  28.74 
 
 
223 aa  62.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 
403 aa  62.4  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  32.86 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  33.08 
 
 
219 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  31.88 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 
215 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  26.38 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  28.28 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  31.36 
 
 
212 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  30.05 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  30.43 
 
 
224 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  23.14 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  28.66 
 
 
261 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  32.12 
 
 
221 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 
224 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.6 
 
 
224 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 
236 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  30.28 
 
 
243 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  30.58 
 
 
221 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.58 
 
 
220 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  30.58 
 
 
221 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  30.58 
 
 
221 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 
255 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  33.05 
 
 
1755 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  32.2 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  32.12 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  30.07 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  30.23 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  32.12 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  23.19 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  21.74 
 
 
343 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  27.38 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  29.59 
 
 
229 aa  53.9  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  23.75 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 
209 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  29.91 
 
 
227 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  32.33 
 
 
200 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 
262 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 
224 aa  52.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  28.36 
 
 
230 aa  52.4  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  33.88 
 
 
209 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  26.37 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 
228 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  31.34 
 
 
477 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  31.97 
 
 
233 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  26.36 
 
 
457 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  29.5 
 
 
222 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  32.24 
 
 
230 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 
228 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.47 
 
 
217 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  27.5 
 
 
263 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  31.46 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  33.61 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1070  hypothetical protein  25.76 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  25.83 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  26.61 
 
 
205 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  33.11 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  33.11 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  28.28 
 
 
228 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  32.23 
 
 
209 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  33.59 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  28.12 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  31.15 
 
 
229 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 
217 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  30.65 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  29.84 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  30.21 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  29.06 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  28.91 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  22.38 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  27.54 
 
 
247 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  30.21 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  29.84 
 
 
263 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  40.28 
 
 
723 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  25.11 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.93 
 
 
220 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  40.28 
 
 
717 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  33.33 
 
 
170 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 
443 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 
216 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  22.81 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0988  OmpA/MotB domain-containing protein  24.13 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 
228 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  26.91 
 
 
266 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>