More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1126 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
433 aa  880  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  69.28 
 
 
431 aa  617  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  2.38529e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  66.13 
 
 
428 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  64.97 
 
 
434 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  51.24 
 
 
436 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  48.14 
 
 
427 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  45.77 
 
 
424 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  46.95 
 
 
429 aa  362  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  43.59 
 
 
441 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  44.88 
 
 
427 aa  343  4e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  41.82 
 
 
432 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  41.04 
 
 
435 aa  328  1e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  40.88 
 
 
443 aa  276  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  37.04 
 
 
495 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
427 aa  236  5e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  33.67 
 
 
419 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 
435 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
431 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  32.9 
 
 
434 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 
434 aa  191  3e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
420 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
435 aa  152  9e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 
451 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
435 aa  137  3e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
422 aa  129  1e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.7 
 
 
438 aa  122  1e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
431 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
444 aa  120  4e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.99953e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
441 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.34 
 
 
426 aa  113  7e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
451 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.53575e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 
441 aa  111  2e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
424 aa  110  7e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
441 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  32.01 
 
 
442 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 
448 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  29.43 
 
 
410 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.99 
 
 
434 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.85 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.85 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.94 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25 
 
 
408 aa  93.2  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 
441 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.07 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 
470 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.75 
 
 
439 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.2 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
417 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 
452 aa  85.1  2e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 
431 aa  85.1  2e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
444 aa  84.3  3e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
425 aa  83.2  8e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 
431 aa  82.4  1e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
422 aa  81.6  2e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 
433 aa  82  2e-14  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  4.88029e-05  hitchhiker  1.84856e-05 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
412 aa  82  2e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 
432 aa  81.6  3e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 
461 aa  80.9  4e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.61 
 
 
451 aa  80.9  4e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 
466 aa  80.5  6e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
412 aa  79.3  1e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
412 aa  79.7  1e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
412 aa  79.7  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  28.64 
 
 
428 aa  78.6  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
458 aa  78.2  2e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
408 aa  77.4  4e-13  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.92518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 
452 aa  77.8  4e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
434 aa  77.4  4e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
455 aa  77.8  4e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 
433 aa  77.4  5e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 
424 aa  77  5e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 
446 aa  77  6e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 
445 aa  77  6e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
428 aa  76.6  8e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
424 aa  75.9  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
420 aa  75.9  1e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  27.85 
 
 
424 aa  75.9  1e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 
429 aa  75.9  1e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 
431 aa  75.1  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.88 
 
 
410 aa  74.3  4e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.88 
 
 
410 aa  74.3  4e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 
414 aa  73.9  4e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  30.86 
 
 
423 aa  73.9  5e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 
446 aa  73.9  6e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
417 aa  73.2  8e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 
416 aa  73.2  9e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
434 aa  72.8  1e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
419 aa  72.8  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
445 aa  72  2e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 
444 aa  71.6  3e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.25 
 
 
429 aa  71.2  4e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
418 aa  71.2  4e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
493 aa  70.5  5e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
421 aa  70.1  6e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1846  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.83 
 
 
442 aa  70.1  8e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.28949e-06  hitchhiker  0.000299807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>