More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1370 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 		 406 aa  794    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  98.61 
 
 		 367 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  49.87 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  50.65 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  48.15 
 
 		 401 aa  342  9e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  43.89 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  44.31 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  44.58 
 
 		 413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  44.87 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  46.41 
 
 		 432 aa  299  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  40.86 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  41.87 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  38.89 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  44.27 
 
 		 412 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  37 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  36.25 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  37.14 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  35.44 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  36.41 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.97 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.66 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  27.3 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  27.78 
 
 		 1347 aa  100  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  29.86 
 
 		 535 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  28.24 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  27.6 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  25.98 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  27.47 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  26.34 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  26.91 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  27.2 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  26.4 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  35.67 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  24.41 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  26.42 
 
 		 436 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  28.09 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  28.28 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.51 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  25.89 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0229  sodium/glutamate symporter family protein, putative  25.86 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.909208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.62 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.62 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  26.69 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  26.59 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  26.9 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  29.17 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.3 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.26 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  26.67 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  26.68 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  26.62 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  27.71 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.44 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25.78 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  31.17 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.95 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  26.26 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  27.49 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  26.26 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  26.74 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  26.35 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  28.18 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  25.07 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  27.55 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  32.2 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.69 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.58 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  27.92 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  30.2 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  27.85 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  30.77 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  27.85 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.18 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  26.12 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  24.71 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  30.73 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  28.76 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.63 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  26.49 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  29.08 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  30.63 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  26.82 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  28.06 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  26.19 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  24.15 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  26.38 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1330  sodium:dicarboxylate symporter  28.68 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  24.34 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06782  amino acid transporter (Eurofung)  27.92 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0737  proton/glutamate symporter  31.21 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.53 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  28.52 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  32.39 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  25.22 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  25.22 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  28.08 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  28.11 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>