More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46672 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  100 
 
 		 1347 aa  2803    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  72.31 
 
 		 535 aa  660    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  30.48 
 
 		 405 aa  190  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  30.59 
 
 		 432 aa  182  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  30.5 
 
 		 481 aa  181  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  28.84 
 
 		 437 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.37 
 
 		 436 aa  162  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  30.17 
 
 		 430 aa  162  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 442 aa  161  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  30.07 
 
 		 445 aa  160  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  28.95 
 
 		 433 aa  160  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  28.74 
 
 		 441 aa  159  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  28.36 
 
 		 424 aa  159  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  27.75 
 
 		 425 aa  159  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.45 
 
 		 436 aa  158  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.64 
 
 		 437 aa  157  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  27.98 
 
 		 444 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 		 439 aa  157  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  29.64 
 
 		 437 aa  157  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  27.71 
 
 		 444 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  27.38 
 
 		 443 aa  157  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  25.87 
 
 		 409 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  27.71 
 
 		 444 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 435 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 440 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  27.56 
 
 		 417 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 440 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  27.47 
 
 		 444 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  27.85 
 
 		 440 aa  155  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 437 aa  155  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  30.29 
 
 		 433 aa  155  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  28.18 
 
 		 437 aa  155  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.92 
 
 		 437 aa  155  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 411 aa  154  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  28.19 
 
 		 440 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  27.85 
 
 		 440 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  27.85 
 
 		 440 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  27.79 
 
 		 434 aa  154  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  27.92 
 
 		 436 aa  154  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  27.05 
 
 		 409 aa  153  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  28.54 
 
 		 427 aa  151  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06782  amino acid transporter (Eurofung)  27.69 
 
 		 471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  30.77 
 
 		 436 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  27.74 
 
 		 432 aa  149  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  28.12 
 
 		 405 aa  149  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  28.81 
 
 		 434 aa  149  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.09 
 
 		 447 aa  149  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  24.94 
 
 		 419 aa  149  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  27.6 
 
 		 444 aa  148  7.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  27.52 
 
 		 410 aa  148  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  28.95 
 
 		 434 aa  148  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.94 
 
 		 445 aa  147  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  26.97 
 
 		 425 aa  147  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  27.05 
 
 		 417 aa  147  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  26.65 
 
 		 411 aa  147  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  27.94 
 
 		 408 aa  147  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  26.62 
 
 		 422 aa  145  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  26.16 
 
 		 411 aa  145  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  26.16 
 
 		 411 aa  145  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  26.41 
 
 		 411 aa  145  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  26.16 
 
 		 411 aa  145  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.16 
 
 		 411 aa  145  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.16 
 
 		 411 aa  145  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  26.16 
 
 		 411 aa  145  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  26.16 
 
 		 411 aa  145  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  28.16 
 
 		 420 aa  145  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  26.65 
 
 		 411 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  26.21 
 
 		 416 aa  142  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  27.1 
 
 		 409 aa  142  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  26.96 
 
 		 413 aa  142  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.19 
 
 		 440 aa  142  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  26.32 
 
 		 408 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  25.93 
 
 		 416 aa  141  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  26.6 
 
 		 416 aa  140  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  25.93 
 
 		 416 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  25.93 
 
 		 416 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  26.85 
 
 		 409 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  26.35 
 
 		 425 aa  140  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  26.9 
 
 		 417 aa  140  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  26.85 
 
 		 409 aa  140  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  25.93 
 
 		 416 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.9 
 
 		 430 aa  139  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  26.6 
 
 		 409 aa  139  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  25.81 
 
 		 432 aa  139  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  28.57 
 
 		 470 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44517  predicted protein  32.06 
 
 		 349 aa  138  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.144831  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  28.71 
 
 		 433 aa  137  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  27.31 
 
 		 449 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  26.11 
 
 		 412 aa  135  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  25.89 
 
 		 408 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  26.86 
 
 		 425 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  25.49 
 
 		 426 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 		 439 aa  133  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  25.89 
 
 		 441 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  31.4 
 
 		 452 aa  134  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37855  predicted protein  30.35 
 
 		 527 aa  132  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  28.75 
 
 		 449 aa  133  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  25.6 
 
 		 439 aa  132  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  24.94 
 
 		 427 aa  132  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  27 
 
 		 419 aa  132  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>