More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  100 
 
 		 432 aa  835    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  59.33 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  52.88 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  50.52 
 
 		 393 aa  362  8e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  46.75 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  49.48 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  45.78 
 
 		 401 aa  316  6e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.41 
 
 		 406 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  44.02 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  43.81 
 
 		 413 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  37.12 
 
 		 408 aa  279  8e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.88 
 
 		 367 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 400 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  38.35 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  41.62 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  37.33 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  37.93 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  34.08 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  35.46 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.5 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.47 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  28.54 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  28.15 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  29.01 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  25.28 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  29.48 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  27.35 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  29.03 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  39.49 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.89 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.8 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.8 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.2 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  26.37 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  26.73 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  28.57 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0229  sodium/glutamate symporter family protein, putative  24.94 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.909208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.7 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  30.94 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  25.56 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  25.81 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  28.65 
 
 		 1347 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0327  serine/threonine transporter SstT  25.7 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  26.94 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  26.07 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  25.12 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  27.23 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  37.91 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  28.97 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  36.42 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  26.46 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  27.69 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  26.23 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  27.38 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  28.97 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  28.85 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0528  serine/threonine transporter SstT  25.83 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276572  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  27.47 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  27.41 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4319  serine/threonine transporter SstT  27.81 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  24.34 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06782  amino acid transporter (Eurofung)  24.67 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  33.17 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  33.05 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.86 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  25.31 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3709  serine/threonine transporter SstT  26.57 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  33.51 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  24.82 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3183  serine/threonine transporter SstT  29.15 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  27.16 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.35 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  25.06 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  27.57 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3251  serine/threonine transporter SstT  27.63 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529789  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  26.77 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  25.69 
 
 		 407 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  31.74 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  30.93 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3530  serine/threonine transporter SstT  28.4 
 
 		 403 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.101717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2443  serine/threonine transporter SstT  27.63 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  25.96 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  25.36 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.3 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2859  serine/threonine transporter SstT  27.18 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00461767  normal  0.0591164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  27.06 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  25 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  28.79 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  27.36 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1070  regulatory protein, ArsR  22.36 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.802527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0383  sodium:dicarboxylate symporter  35.33 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848408 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  25.96 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  26.01 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  33.74 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  26.27 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  26.3 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  27.06 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>