More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1002 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 432 aa  852    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  70.74 
 
 		 441 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  48.68 
 
 		 405 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  41.03 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  41.78 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  42.71 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  41.07 
 
 		 436 aa  276  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  40.89 
 
 		 436 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  38.95 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  40.65 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  40.65 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  40.65 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  40.47 
 
 		 437 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  40.24 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 437 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  38.75 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  39.91 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  40.05 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  41.79 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  38.65 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 		 441 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  39.2 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  39.18 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  37.94 
 
 		 433 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  36.53 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  37.65 
 
 		 434 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.59 
 
 		 437 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  37.17 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  38 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  37.56 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  36.05 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  39.85 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  36.56 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  37.53 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  40.55 
 
 		 470 aa  245  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  37.09 
 
 		 444 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  38.17 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  36.08 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  35.93 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  36.05 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  36.08 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  36.08 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  35.85 
 
 		 411 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  35.85 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  36.77 
 
 		 449 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  35.85 
 
 		 411 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.61 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  35.38 
 
 		 411 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  35.38 
 
 		 411 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.38 
 
 		 411 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  35.38 
 
 		 411 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  35.7 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  36.62 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  37.5 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  36.41 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  40.82 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  36.08 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  37.24 
 
 		 448 aa  226  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  37.07 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  34.67 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  34.39 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  37.21 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  36.16 
 
 		 422 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  34.37 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  37.24 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  35.39 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  34.66 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  35.58 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  35.58 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  33.11 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  33.11 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  32.42 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  33.11 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  32.16 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.17 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  32.42 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  33.93 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2861  Sodium/dicarboxylate symporter  36.48 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0942349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  32.88 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  32.88 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  33.71 
 
 		 430 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  32.19 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  32.55 
 
 		 423 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  35.7 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.5 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  33.57 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  34.05 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  33.79 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  31.66 
 
 		 479 aa  203  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  34.37 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  34.37 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>