More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2738 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 413 aa  818    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  65.02 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  62.01 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  39.07 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  38.33 
 
 		 440 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  38.04 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  37.59 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  37.59 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  38.97 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  37.44 
 
 		 436 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  38.73 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  38.48 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  36.17 
 
 		 447 aa  256  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  38.79 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  36.08 
 
 		 449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.41 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  37.14 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  36.45 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  37.19 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  36.97 
 
 		 439 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  37.93 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  36.44 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  36.86 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  36.86 
 
 		 440 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  36.86 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  38.67 
 
 		 417 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  35.94 
 
 		 451 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  35.68 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  38.21 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  38.24 
 
 		 441 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  37.09 
 
 		 411 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  36.79 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.84 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  36.87 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  36.62 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.62 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  36.84 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  36.62 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  36.62 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  38.8 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  34.29 
 
 		 449 aa  243  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  36.84 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  36.08 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  36.05 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  36.08 
 
 		 457 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  36.34 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  36.41 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  35.51 
 
 		 457 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  36.11 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  34.46 
 
 		 445 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  35.81 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  34.64 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  32.76 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  35.85 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  34.88 
 
 		 441 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.15 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.66 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  36.19 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  32.61 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  34.39 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  35.89 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  36.95 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  35.25 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  33.57 
 
 		 425 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  33.98 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  33.98 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  33.98 
 
 		 423 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  33.98 
 
 		 423 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  33.98 
 
 		 424 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  33.98 
 
 		 423 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  33.98 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  34.96 
 
 		 425 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  33.74 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  34.47 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  35.54 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  34.38 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05172  glutamate-aspartate symport protein  36.3 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  33.88 
 
 		 448 aa  216  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  34.74 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  33.74 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  34.88 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  30.58 
 
 		 405 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1330  sodium:dicarboxylate symporter  37.43 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  32.72 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  33.66 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  33.66 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  34.29 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  35.48 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  33 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  35.51 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  31.08 
 
 		 423 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  34.68 
 
 		 432 aa  206  7e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  31.07 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>