More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6400 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 470 aa  928    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  48.08 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  49.1 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  46.59 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  40.64 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  39.27 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  36.85 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.73 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  41.71 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  36.84 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  36.24 
 
 		 436 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  36.18 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  35.67 
 
 		 437 aa  249  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  36.57 
 
 		 437 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  36.34 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  35.92 
 
 		 440 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  35.92 
 
 		 440 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  35.92 
 
 		 440 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  36.83 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  35.7 
 
 		 440 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  34.11 
 
 		 409 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.02 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  35.1 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  37.22 
 
 		 439 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  37.41 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  35.62 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  34.45 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  34.33 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  34.14 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  31.24 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  34.44 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  35.03 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 449 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  35.43 
 
 		 430 aa  232  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  36.34 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.37 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  34.93 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  34.65 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  34.65 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  34.56 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  34.43 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  34.65 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  34.33 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.6 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  34.1 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  34.33 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  34.28 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  34.7 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  33.85 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  34.2 
 
 		 423 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  34.22 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  33.55 
 
 		 423 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2261  sodium:dicarboxylate symporter  36.76 
 
 		 488 aa  227  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  33.55 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  33.55 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  33.48 
 
 		 443 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  34.61 
 
 		 438 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  33.77 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  34.68 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  34.38 
 
 		 424 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  34.61 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  34.51 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  34 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  34.38 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  35.53 
 
 		 439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  34.51 
 
 		 411 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  34.51 
 
 		 411 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.51 
 
 		 411 aa  223  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  34.51 
 
 		 411 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  34.51 
 
 		 411 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  34.51 
 
 		 411 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  32.61 
 
 		 423 aa  222  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.27 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  36.38 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  34.51 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  36.38 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  35.43 
 
 		 417 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  34.61 
 
 		 438 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  32.1 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  34.39 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  33.33 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  35.06 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  34.77 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  33.33 
 
 		 444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  33.63 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  36.27 
 
 		 410 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  33.11 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  33.48 
 
 		 447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  34.04 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  35.41 
 
 		 438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  33.33 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  34.52 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  33.33 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  33.33 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  33.33 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  33.33 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  33.33 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>