More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2261 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2261  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 488 aa  971    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  41.28 
 
 		 441 aa  316  8e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1033  proton glutamate symport protein  42.72 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.207746  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0909  sodium:dicarboxylate symporter  42.54 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  44.39 
 
 		 424 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  44.39 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2861  Sodium/dicarboxylate symporter  46.56 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0942349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02342  proton glutamate symport protein  40.05 
 
 		 409 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  35.29 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  36.54 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0383  sodium:dicarboxylate symporter  39.21 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  35.81 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  35.43 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  35.18 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  34.17 
 
 		 433 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  35.18 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  35.18 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  34.44 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  33.94 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.07 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  33.94 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  33.94 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  34.62 
 
 		 411 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  34.97 
 
 		 424 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  34.2 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  34.39 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  34.39 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  34.4 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  34.39 
 
 		 411 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.39 
 
 		 411 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  30.46 
 
 		 425 aa  227  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  34.16 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.16 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  34.16 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  34.16 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  32.37 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  31.97 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  35.27 
 
 		 451 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  34.64 
 
 		 411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  33.93 
 
 		 437 aa  223  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  34.57 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  35.73 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  35.68 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.25 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  34.08 
 
 		 442 aa  220  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  33.18 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  32.56 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  33.94 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  32.35 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.78 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  33.41 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  33.78 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  34.25 
 
 		 452 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  33.57 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  33.86 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  32.16 
 
 		 481 aa  216  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  32.95 
 
 		 457 aa  216  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  33.49 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  32.88 
 
 		 437 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  35.61 
 
 		 422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  33.48 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  33.18 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 		 440 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  32.21 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  35.51 
 
 		 479 aa  212  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.89 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  34.11 
 
 		 436 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  33.65 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  38.24 
 
 		 470 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  31.3 
 
 		 445 aa  203  7e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  31.86 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  28.87 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  31.67 
 
 		 430 aa  201  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  32.65 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  32.58 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  33.86 
 
 		 441 aa  199  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  32.34 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  32.65 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  29.32 
 
 		 437 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  29.44 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  33.09 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  32.04 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  30.07 
 
 		 432 aa  193  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  28.99 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  31.82 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  31.8 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  29.88 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  31.8 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  28.99 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  28.99 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  28.99 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  31.55 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  28.76 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>