More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05172 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05172  glutamate-aspartate symport protein  100 
 
 		 435 aa  841    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1330  sodium:dicarboxylate symporter  68.18 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  35.7 
 
 		 422 aa  229  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  36.3 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  36.31 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  34.29 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  35.68 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  35.89 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  34.42 
 
 		 449 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  33.25 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.65 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  33.68 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  33.68 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  32.9 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  33.68 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  32.13 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  33.61 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  33.51 
 
 		 437 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  31.89 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  32.98 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  31.89 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  31.89 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  32.12 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  33.16 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  34.2 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  32.12 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.67 
 
 		 436 aa  202  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  30.41 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  32.37 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.97 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  30.66 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  33.16 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  33.06 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  31.51 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  33.67 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  31.25 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  32.8 
 
 		 441 aa  186  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  33.33 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  35.86 
 
 		 437 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  31.47 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  31.2 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  33.06 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  32.6 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  31.2 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  30.68 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  32.89 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  31.12 
 
 		 434 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  35.38 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  31.9 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  32.83 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  31 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  30.46 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  29.6 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  30.45 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  29.6 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  29.37 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.37 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.37 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  29.37 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  29.37 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  29.1 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  29.91 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  30.1 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  30.1 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  30.71 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  28.84 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  31.15 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  31.16 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  28.53 
 
 		 412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  31.64 
 
 		 441 aa  166  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  28.78 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  32.8 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  31.16 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  30.95 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  31.04 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  29.08 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  30.81 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  29.66 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  30.73 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  30.21 
 
 		 436 aa  163  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0917  Sodium:dicarboxylate symporter  32.56 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0420042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  29.08 
 
 		 409 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  30.3 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  30.3 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  30.3 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  30.3 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  28.31 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  29.08 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  31.01 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  30.3 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  29.12 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  30.14 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  32.35 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  29.27 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  30.29 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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