More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0908 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 399 aa  781    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  59.84 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  57.07 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  52.09 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  49.87 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  50.13 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  48.47 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  48.62 
 
 		 413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  49.59 
 
 		 367 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  48.7 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  46.75 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  44.36 
 
 		 408 aa  322  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  42.97 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  46.84 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  42.34 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  40.42 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  38.08 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.49 
 
 		 387 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  39.38 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  42.94 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  30.77 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  25.92 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  27.84 
 
 		 442 aa  92.8  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.34 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.37 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.91 
 
 		 439 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  23.74 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.15 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.67 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  28.19 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  27.59 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  27.14 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  26.5 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  26.68 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  27.08 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  27.75 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  30.35 
 
 		 1347 aa  86.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  26.08 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  27.07 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  28.67 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.52 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.43 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  26.96 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.43 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  27.48 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  26.75 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  27.29 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  23.75 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.41 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  27.98 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.01 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.05 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  27.36 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  28.43 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4033  serine/threonine transporter SstT  29.06 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161569  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  26.16 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  25.67 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  27.25 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  30.09 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  25.55 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  25.98 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0917  hypothetical protein  26.82 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  26.33 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  25.96 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  27.67 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0504  serine/threonine transporter SstT  27.2 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0947  hypothetical protein  27.11 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  32.93 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1052  serine/threonine transporter SstT  24.49 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  25.19 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  28.64 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  26.75 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  26.88 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  27.92 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  28.49 
 
 		 535 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1458  serine/threonine transporter SstT  28.13 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.811029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  26.56 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  27.21 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0229  sodium/glutamate symporter family protein, putative  24.68 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.909208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  26.44 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0449  Sodium:dicarboxylate symporter  33.1 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  26.92 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  24.78 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  26.37 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  25.99 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2492  serine/threonine transporter SstT  27.55 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.33 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  25.96 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  26.59 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2898  serine/threonine transporter SstT  27.75 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0103964 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  28.52 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  26.2 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  27.16 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  26.08 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  26.08 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  25.68 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0702  serine/threonine transporter SstT  26.84 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>