More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1064 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
401 aa  790    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  57.07 
 
 
399 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  55.81 
 
 
393 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  51.82 
 
 
392 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  48.85 
 
 
400 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  47.12 
 
 
433 aa  350  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  47.56 
 
 
406 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  47.78 
 
 
413 aa  342  9e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  48.2 
 
 
400 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  47.5 
 
 
408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  43.75 
 
 
404 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  49.25 
 
 
367 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  48.99 
 
 
412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  45.78 
 
 
432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  42.24 
 
 
400 aa  306  3e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  38.48 
 
 
409 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  37.27 
 
 
397 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  39.02 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  35.05 
 
 
401 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.54 
 
 
387 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.39 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  26.3 
 
 
381 aa  96.7  7e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.31 
 
 
434 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  28.18 
 
 
425 aa  90.1  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.41 
 
 
447 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  27.42 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  25.88 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  25.62 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  31.2 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  26.29 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  25.52 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  25.52 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  25.52 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  27.02 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  26.62 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  27.96 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  28.1 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  25.29 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  25.29 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  25.29 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  25.29 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  25.29 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 
457 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  27.49 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  28.36 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25.06 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.4 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.14 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  27.99 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  25.4 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  26.32 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  25.23 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  26.26 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  24.21 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  29.93 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  25.3 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  27.63 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  28.15 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  25.54 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  24.68 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  25.3 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06782  amino acid transporter (Eurofung)  29.63 
 
 
471 aa  77  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  23.38 
 
 
437 aa  77  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  29.67 
 
 
409 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  25.3 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  25.3 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  33.51 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  24.1 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  26.49 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  24.42 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  25.28 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  26.33 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  25.13 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  26.19 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  23.76 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.35 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  23.81 
 
 
436 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  26.3 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  26.49 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0504  serine/threonine transporter SstT  24.56 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  23.35 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  25.44 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  24.04 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.29 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  27.45 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  24.65 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  27 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  25.61 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  25.84 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  26.29 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  25.81 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  25.24 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.01 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  24.26 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  26.48 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  26.09 
 
 
1347 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  23.83 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  24.18 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  27.95 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>