More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3722 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  92.46 
 
 		 398 aa  696    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  91.96 
 
 		 398 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  91.46 
 
 		 398 aa  687    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  91.96 
 
 		 398 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  99.25 
 
 		 415 aa  773    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 400 aa  781    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  98.25 
 
 		 414 aa  765    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  78.59 
 
 		 420 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  76.71 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  75.82 
 
 		 405 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  78.86 
 
 		 409 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  75.06 
 
 		 407 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  36.55 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  39.04 
 
 		 405 aa  285  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  39.1 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  39.1 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  38.85 
 
 		 405 aa  278  8e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  38.85 
 
 		 405 aa  278  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  38.85 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  38.85 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  38.85 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  38.6 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  38.6 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  38.6 
 
 		 405 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  35.95 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  35.62 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  37.3 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  34.95 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  37.13 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  35.1 
 
 		 406 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  34.41 
 
 		 420 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  35.32 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  34.81 
 
 		 415 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  34.25 
 
 		 415 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  29.21 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.53 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.72 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  29.04 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.84 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 444 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 444 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  27.08 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  28.92 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.72 
 
 		 442 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  28.85 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  30.2 
 
 		 419 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  28.8 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1575  sodium:dicarboxylate symporter  28.21 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120491  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  29.07 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  28.1 
 
 		 437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  28.37 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  28.42 
 
 		 437 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  29.21 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  28.42 
 
 		 437 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  28.16 
 
 		 437 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  28.32 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3684  sodium:dicarboxylate symporter  28.61 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.47 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  28.85 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  27.88 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.07 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  27.88 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  27.88 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  26.38 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  27.88 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3162  sodium:dicarboxylate symporter  27.71 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  27.7 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  26.68 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  29.95 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  28.3 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  27.58 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  26.5 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3283  sodium:dicarboxylate symporter  30.03 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  27.32 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  26.69 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  26.36 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  25.19 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  26.93 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  25.77 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  26.87 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1457  sodium:dicarboxylate symporter  27.04 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  27.82 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  26.75 
 
 		 411 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  27.1 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  26.84 
 
 		 409 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  26.21 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0112  sodium:dicarboxylate symporter  25.95 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000289227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  26.21 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  27.43 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  26.21 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  26.75 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  26.09 
 
 		 457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  28.07 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  26.5 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>