More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0757 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 409 aa  796    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  77.39 
 
 		 420 aa  616  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  77.08 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  77.08 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  76.83 
 
 		 414 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  77.08 
 
 		 398 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  75.31 
 
 		 405 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  77.08 
 
 		 398 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  77.33 
 
 		 398 aa  577  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  77.08 
 
 		 398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  72.08 
 
 		 399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  75.82 
 
 		 407 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  38 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  38.25 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  38.25 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  38 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  38 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  38 
 
 		 405 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  38 
 
 		 405 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  38 
 
 		 405 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  37.75 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  37.75 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  37.75 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  35 
 
 		 411 aa  253  6e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  35.73 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  35.98 
 
 		 412 aa  249  7e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  37.87 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  35.03 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 406 aa  226  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  33.58 
 
 		 420 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  33.67 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  32.26 
 
 		 415 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  31.99 
 
 		 415 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  31.69 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  30.81 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  29.92 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.65 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  29.7 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  30.56 
 
 		 436 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  29.93 
 
 		 437 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  29.93 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  29.72 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  30.25 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  29.97 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  29.97 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  29.97 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  30.34 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  29.64 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  29.26 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.76 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  29.56 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  28.92 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  29.76 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  29.38 
 
 		 457 aa  133  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  30.98 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  28.42 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  30.17 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  28.53 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  28.27 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  28.53 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  28.18 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  28.53 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  29.4 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  27.66 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3283  sodium:dicarboxylate symporter  29.82 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  27.73 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.68 
 
 		 409 aa  126  7e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  29.25 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  28.3 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  27.99 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  28.87 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  27.48 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  28.69 
 
 		 445 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  27.25 
 
 		 449 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  27.2 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  26.88 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  28.24 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  28.11 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  28.57 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  28.2 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  27.88 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  28.2 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  28.2 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.16 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  26.87 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  27.16 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1575  sodium:dicarboxylate symporter  26.08 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120491  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  27.16 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  25.63 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  25.63 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  25.59 
 
 		 439 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  25.69 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3684  sodium:dicarboxylate symporter  25.53 
 
 		 435 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  27.79 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  26.9 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  26.41 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  29.74 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3162  sodium:dicarboxylate symporter  25.63 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  29.41 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>