More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0263 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
411 aa  808    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  57.11 
 
 
412 aa  463  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  50.62 
 
 
405 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  50.87 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  51.12 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  47.76 
 
 
411 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  41.19 
 
 
420 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  39.75 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  42.44 
 
 
407 aa  303  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  36.88 
 
 
415 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  36.52 
 
 
413 aa  279  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  36.7 
 
 
415 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  40.4 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  36.59 
 
 
414 aa  265  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  37.79 
 
 
399 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  36.07 
 
 
420 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  35.95 
 
 
400 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  34.99 
 
 
415 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  37.17 
 
 
405 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  37.13 
 
 
407 aa  243  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  35.66 
 
 
409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  35.58 
 
 
398 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  35.62 
 
 
398 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  35.58 
 
 
398 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  35.07 
 
 
398 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  31.07 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  27.9 
 
 
432 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  29.24 
 
 
424 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  29.38 
 
 
449 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  31.97 
 
 
417 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  27.85 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  27.38 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  27.85 
 
 
444 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  27.85 
 
 
444 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  28.04 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  28.29 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  28.01 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  27.6 
 
 
444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  30.4 
 
 
402 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  28.1 
 
 
413 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  26.65 
 
 
413 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  29.19 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.91 
 
 
409 aa  153  5e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  30.15 
 
 
409 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 
419 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  28.26 
 
 
420 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 
419 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 
419 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  27.66 
 
 
419 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  28.12 
 
 
416 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  28.22 
 
 
416 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  28.22 
 
 
416 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  28.12 
 
 
416 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.75 
 
 
409 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  28.43 
 
 
417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  28.43 
 
 
417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.5 
 
 
409 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  27.11 
 
 
416 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  28.17 
 
 
417 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  26.81 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  27.12 
 
 
441 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  28.21 
 
 
416 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.7 
 
 
439 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  27.53 
 
 
437 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.25 
 
 
409 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  28.97 
 
 
408 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  27.43 
 
 
412 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  27.96 
 
 
440 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  27.96 
 
 
440 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  27.36 
 
 
437 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  27.96 
 
 
440 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  27.61 
 
 
447 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.45 
 
 
436 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  27.59 
 
 
417 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  27.16 
 
 
441 aa  143  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.61 
 
 
436 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  27.19 
 
 
432 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  27.32 
 
 
437 aa  143  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  29.95 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  28.53 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  26.72 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.37 
 
 
437 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  27.75 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 
427 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  27.82 
 
 
416 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  28.83 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  27.65 
 
 
416 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  27.55 
 
 
445 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  29.34 
 
 
437 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>