More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0155 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 412 aa  804    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  56.97 
 
 		 411 aa  482  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  52.11 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  52.11 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  51.74 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  52.11 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  52.11 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  51.74 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  52.11 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  52.11 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  51.86 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  51.86 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  52.24 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 403 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  42.44 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  42.44 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  40.99 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  40.49 
 
 		 415 aa  312  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 406 aa  299  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  36.7 
 
 		 413 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  39.1 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  37.44 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  34.41 
 
 		 415 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  34.94 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  34.5 
 
 		 414 aa  256  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  34.65 
 
 		 420 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  35.9 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  34.85 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  35.31 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  35.04 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  34.94 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  32.88 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  34.68 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  30.08 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  30.08 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  29.82 
 
 		 444 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  29.82 
 
 		 444 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  29.57 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  29.24 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  28.78 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  28.43 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  29.47 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  29.47 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  29.47 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  32.05 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  29.29 
 
 		 424 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  31.38 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.87 
 
 		 409 aa  161  3e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  28.54 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  27.36 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  28.54 
 
 		 433 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  30.09 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  28.71 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  28.71 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  28.71 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  28.26 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  28.36 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  27.82 
 
 		 447 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  28.65 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  28.65 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  28.65 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  28.65 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  27.45 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  29.24 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  26.73 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.94 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.94 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.08 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.98 
 
 		 436 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  28.97 
 
 		 402 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  28.02 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  27.01 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  27.59 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  28.32 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  27.14 
 
 		 419 aa  143  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  27.38 
 
 		 437 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  27.64 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  27.59 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.1 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.1 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  26.68 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  27.59 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  27.32 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  30.75 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  28.15 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  28.26 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3162  sodium:dicarboxylate symporter  27.05 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  26.5 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  26.63 
 
 		 422 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  28.29 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  27.11 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3684  sodium:dicarboxylate symporter  26.87 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  26.5 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  27.59 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  26.89 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  26.25 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>