More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3453 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 407 aa  793    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  75.06 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  75.57 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  74.43 
 
 		 420 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  73.54 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  74.81 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  74.56 
 
 		 405 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  74.3 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  76.02 
 
 		 409 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  74.3 
 
 		 398 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  74.05 
 
 		 398 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  73.79 
 
 		 398 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  35.7 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  37.72 
 
 		 405 aa  275  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  37.47 
 
 		 405 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  37.47 
 
 		 405 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  37.22 
 
 		 405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  36.96 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  37.22 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  37.22 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  37.22 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  36.96 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  36.96 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  36.96 
 
 		 405 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  36.25 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  38.4 
 
 		 411 aa  255  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  34.19 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  32.53 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  35.54 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  33.17 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  34.68 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  30.79 
 
 		 415 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  30.25 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  31.84 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  30.33 
 
 		 437 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  30.67 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.07 
 
 		 436 aa  143  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  30.03 
 
 		 447 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  30.73 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  30.73 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  30.81 
 
 		 436 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  30.98 
 
 		 440 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  29.17 
 
 		 444 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  29.17 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  29.17 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  29.17 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.8 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  30.43 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.03 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  27.86 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  30.02 
 
 		 439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  30.71 
 
 		 440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  30.71 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  30.71 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  29.89 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  29.09 
 
 		 424 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  30.08 
 
 		 443 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  30.32 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  29.52 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  29.52 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  29.52 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  29.37 
 
 		 449 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  30.33 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  29.41 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  27.27 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  27.54 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.54 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  27.95 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.57 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  27.03 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  28.34 
 
 		 434 aa  126  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  28.19 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  29.76 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  28.28 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  28.57 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  28.54 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.69 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  28.28 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.28 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.28 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  28.28 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  28.28 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  31.1 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  28.28 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  28.03 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  28.28 
 
 		 411 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  28.26 
 
 		 413 aa  123  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  29.13 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  26.78 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  27.79 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.18 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.44 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.44 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  27.66 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  26.67 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  28.65 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  27.38 
 
 		 457 aa  120  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3283  sodium:dicarboxylate symporter  29.83 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  26.63 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>