More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0305 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  99.25 
 
 		 398 aa  767    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 398 aa  773    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  99.5 
 
 		 398 aa  769    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  91.71 
 
 		 415 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  91.96 
 
 		 400 aa  718    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  98.74 
 
 		 398 aa  763    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  91.21 
 
 		 414 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  77.83 
 
 		 420 aa  616  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  75.44 
 
 		 399 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  77.08 
 
 		 405 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  79.4 
 
 		 409 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  74.3 
 
 		 407 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  36.29 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  40.05 
 
 		 405 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  40.05 
 
 		 405 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  39.54 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  39.8 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  39.8 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  39.8 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  39.8 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  39.8 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  39.54 
 
 		 405 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  39.54 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  35.7 
 
 		 411 aa  252  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  37.83 
 
 		 411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  35.69 
 
 		 412 aa  243  6e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  34.95 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  37.1 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  34.09 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  35.46 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  33.67 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  33.98 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  33.43 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  29.66 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.93 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  29.32 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.77 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  29.21 
 
 		 442 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  27.49 
 
 		 449 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  29.4 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  29.4 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  27.79 
 
 		 409 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.84 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.42 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 444 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  27.08 
 
 		 444 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3283  sodium:dicarboxylate symporter  30.46 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  29.38 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  27.65 
 
 		 409 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  27.08 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  26.8 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  27.73 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  28.65 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  29.37 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.38 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.33 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  26.3 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.38 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  28.38 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  28.38 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  28.38 
 
 		 437 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.09 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  27.09 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  27.09 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  28.46 
 
 		 437 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  25.19 
 
 		 408 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  28.38 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  26.84 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  27.45 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  27.41 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  26.6 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.47 
 
 		 437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3684  sodium:dicarboxylate symporter  28.02 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3162  sodium:dicarboxylate symporter  27.1 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  26.04 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1575  sodium:dicarboxylate symporter  28.21 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120491  normal  0.370091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2056  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  26.84 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  28.21 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  28.21 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  26.38 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.99 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  27.27 
 
 		 457 aa  116  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  28.3 
 
 		 441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  27.44 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  27.65 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  26.83 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  27.75 
 
 		 448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  26.39 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  27.5 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  27 
 
 		 457 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  27.27 
 
 		 457 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2740  C4-dicarboxylate transporter DctA  26.09 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0765011  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  25.78 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  27.4 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  27.71 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  28.85 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1457  sodium:dicarboxylate symporter  26.06 
 
 		 438 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>