More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0546 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 411 aa  798    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  53.1 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  53.1 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  52.85 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  52.85 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  53.1 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  52.85 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  52.85 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  52.61 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  52.61 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  52.61 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  52.61 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  50.13 
 
 		 412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  47.76 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  45.81 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  44.22 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 406 aa  322  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  43.47 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  40.93 
 
 		 413 aa  300  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  39.73 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  37.66 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  37.28 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  38.02 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  37.03 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  37.03 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  34.78 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  38.32 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  37.84 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  37.84 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  37.3 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  37.3 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  29.78 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.69 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  30.35 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  30.35 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  30.35 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.65 
 
 		 410 aa  152  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  29.85 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  29.43 
 
 		 430 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  29.62 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  28.61 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  30.38 
 
 		 409 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  29.81 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  28 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  27.05 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  27.05 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  31.15 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  29.1 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  26.81 
 
 		 423 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  28 
 
 		 435 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  26.57 
 
 		 423 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  28 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  28 
 
 		 440 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  28.86 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  27.68 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  29.01 
 
 		 442 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  25.72 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  26.57 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.53 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  27.01 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  26.81 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  26.81 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  29.32 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  29.32 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.32 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  29.32 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  29.32 
 
 		 411 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  28.74 
 
 		 434 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  28.04 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  28.74 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  31.08 
 
 		 405 aa  136  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  29.06 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  26.33 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  28.11 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.95 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  28.26 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.06 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  26.35 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  26.33 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  29.06 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  29.68 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  29.06 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  29.58 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  29.32 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  29.32 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  28.96 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  29.32 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.27 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  28.3 
 
 		 437 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  27.3 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  25.62 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  28.8 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  25.62 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  25.62 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  25.62 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  28.61 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>