More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1036 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  99.74 
 
 		 387 aa  748    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 		 387 aa  748    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  58.96 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  64.19 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  60.05 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  55.94 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  42.75 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  40.58 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  38.56 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.66 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  38.46 
 
 		 392 aa  250  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  38.76 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  39.39 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  35.14 
 
 		 408 aa  222  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.2 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  34.04 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.74 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  33 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  35.22 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.73 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  27.46 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  27.03 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  25.3 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.45 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  26.16 
 
 		 1347 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  23.32 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  29.17 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  29.89 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  26.74 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  25.06 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.32 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25.63 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  25.66 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  25.93 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  25.66 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  30.16 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.74 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  25.63 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  29.11 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  24.4 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  26.34 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  26.69 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.69 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  26.69 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  26.87 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  26.69 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  25.2 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  27.03 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  26.49 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.69 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  25.29 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  26.74 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  26.49 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  26.09 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  25 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  26.92 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  26.73 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  25.46 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  25.2 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  25.2 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0327  serine/threonine transporter SstT  24.68 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1748  serine/threonine transporter SstT  27.12 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522242  normal  0.0298803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2492  serine/threonine transporter SstT  26.75 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0449  Sodium:dicarboxylate symporter  27.8 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  30.87 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1458  serine/threonine transporter SstT  25.89 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.811029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  26.55 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0230  serine/threonine transporter SstT  25.5 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  26.15 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2707  serine/threonine transporter SstT  25.95 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  27.46 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  27.58 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3122  serine/threonine transporter SstT  26.62 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  26.81 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1373  serine/threonine transporter SstT  26.75 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0106659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1438  serine/threonine transporter SstT  26.75 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  26.6 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  26.53 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1091  serine/threonine transporter SstT  27.37 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  28.85 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  26.81 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1426  serine/threonine transporter SstT  26.5 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  26.94 
 
 		 451 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  26.6 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  27 
 
 		 535 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2898  serine/threonine transporter SstT  26.97 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0103964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2795  serine/threonine transporter SstT  27.25 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2935  serine/threonine transporter SstT  27.25 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1562  serine/threonine transporter SstT  27.25 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314935  hitchhiker  0.000983566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2815  serine/threonine transporter SstT  27.25 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  30.98 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  26.6 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  26.46 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1464  serine/threonine transporter SstT  26.7 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  25.12 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  25.33 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  30.27 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  23.43 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  23.81 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>