More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0914 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 400 aa  795    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  55.73 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  52.52 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  50.13 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  49.47 
 
 		 401 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  48.24 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  50.28 
 
 		 432 aa  335  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.65 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  42.6 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  39.25 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  42.28 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.32 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  40.76 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  39.74 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  42.29 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.82 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  34.43 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  36.29 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  34.91 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.56 
 
 		 387 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  33.61 
 
 		 391 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  28.3 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  26.03 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  24.8 
 
 		 1347 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  28.34 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  29.27 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  27.2 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  29 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  28.54 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  25.63 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  26.9 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  25.24 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  30.57 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  26.47 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  26.86 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  30.93 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  26.86 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  23.53 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  26.27 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  24.88 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  24.88 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1458  serine/threonine transporter SstT  27.2 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.811029  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0917  hypothetical protein  25.36 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  25.93 
 
 		 535 aa  76.6  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  28.33 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  27.87 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  26.39 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  26.98 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  26.32 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  23.15 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  25.85 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  29.3 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1330  sodium:dicarboxylate symporter  29.5 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  26.1 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  24.36 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0947  hypothetical protein  26.49 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2859  serine/threonine transporter SstT  26 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00461767  normal  0.0591164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  34.13 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  26.7 
 
 		 490 aa  73.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  25.48 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1464  serine/threonine transporter SstT  27.14 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  27.95 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  24.36 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  24.82 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  27.53 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  25.23 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  23.21 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  24 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  23.9 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  25.8 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3183  serine/threonine transporter SstT  27.97 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  27.19 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  25.92 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_002978  WD0229  sodium/glutamate symporter family protein, putative  23.31 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.909208  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  27.27 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1115  serine/threonine transporter SstT  26.96 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3122  serine/threonine transporter SstT  27.14 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  23.57 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  26.18 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  24.14 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0533  serine/threonine transporter SstT  26.19 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  24.5 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  24.64 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  24.12 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  25.48 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  24.14 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  27.78 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  24.12 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  27.09 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  25.16 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1748  serine/threonine transporter SstT  26.29 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522242  normal  0.0298803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1426  serine/threonine transporter SstT  26 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1052  serine/threonine transporter SstT  25.92 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  24.41 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  24.41 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1240  serine/threonine transporter SstT  26.51 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>