More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2814 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
400 aa  796    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  57.5 
 
 
404 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  50.5 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  55.33 
 
 
412 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  45.25 
 
 
393 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 
399 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  42.6 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  41.77 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  41.98 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  41.94 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  41.43 
 
 
413 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40 
 
 
406 aa  262  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  38.23 
 
 
432 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.09 
 
 
433 aa  247  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.42 
 
 
367 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  30.83 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  29.65 
 
 
409 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  29.68 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  29.43 
 
 
391 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.75 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.61 
 
 
387 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  26.33 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  25.63 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  28.54 
 
 
433 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  29.83 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  28.03 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  27.49 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  27.53 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  28.24 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  28 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  29.44 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  27.12 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  27.16 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.27 
 
 
436 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  27.99 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  27.46 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.95 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  28.57 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  30 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  26.46 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  27.46 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  26.27 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  26.75 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1091  serine/threonine transporter SstT  26.24 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  26.67 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  25.97 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  26.81 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0702  serine/threonine transporter SstT  28.06 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0528  serine/threonine transporter SstT  25 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  28.26 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  32.04 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  27.15 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  27.01 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  29 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.22 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  25.77 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10570  Na+/serine symporter  27.27 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000939446  hitchhiker  0.000000018632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.81 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  28.02 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0504  serine/threonine transporter SstT  26.95 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0750  serine/threonine transporter SstT  28.95 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05210  Na+/serine symporter  27.38 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.846221  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  26.3 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  25.35 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2525  serine/threonine transporter SstT  28.46 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.114081  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0720  serine/threonine transporter SstT  27.04 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  28.85 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1330  sodium:dicarboxylate symporter  28.46 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  26.1 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0533  serine/threonine transporter SstT  25.77 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  26.33 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.02 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4319  serine/threonine transporter SstT  29.2 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.02 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  27.17 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3183  serine/threonine transporter SstT  27.93 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453093  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1373  serine/threonine transporter SstT  25.9 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0106659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.38 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  28.61 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  25.93 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3530  serine/threonine transporter SstT  27.2 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.101717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3251  serine/threonine transporter SstT  26.63 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529789  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2859  serine/threonine transporter SstT  28.14 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00461767  normal  0.0591164 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  25.66 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  32.34 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  28.06 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  28.61 
 
 
437 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1438  serine/threonine transporter SstT  25.38 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  23.28 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  28.06 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  27.58 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3272  serine/threonine transporter SstT  27.02 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0611  serine/threonine transporter SstT  27.02 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1426  serine/threonine transporter SstT  25.64 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  26.28 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2443  serine/threonine transporter SstT  26.35 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3557  serine/threonine transporter SstT  26.52 
 
 
414 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>