More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2814 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
413 aa  803    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  80.78 
 
 
400 aa  630  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  48.62 
 
 
399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  49.48 
 
 
393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  47.78 
 
 
401 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.34 
 
 
406 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  45.81 
 
 
392 aa  305  9.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  42.28 
 
 
400 aa  292  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  38.9 
 
 
408 aa  279  7e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.21 
 
 
367 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  41.71 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  39.19 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  43.81 
 
 
432 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  41.43 
 
 
400 aa  268  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  41.49 
 
 
412 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  40.1 
 
 
409 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  35.45 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  38.32 
 
 
397 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.02 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  36.26 
 
 
391 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.39 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  26.65 
 
 
381 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  29.95 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  29.73 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  29.73 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  29.78 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  29.75 
 
 
440 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  29.56 
 
 
437 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  29.33 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.12 
 
 
437 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.31 
 
 
436 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.71 
 
 
442 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.09 
 
 
436 aa  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.98 
 
 
447 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.6 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  28.67 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  28.71 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  28.07 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  33.1 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  25.77 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  28.03 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  25.98 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  32.75 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.54 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  26.72 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  29.21 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  27.27 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  28.36 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  27.59 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  27.19 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.29 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  26.02 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 
439 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  26.81 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  28.12 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0720  serine/threonine transporter SstT  32.52 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  27.36 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  27.69 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.15 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  28.96 
 
 
1347 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  27.8 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  26.56 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  28.82 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  26.97 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  26.97 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  26.97 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  29.2 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  29.12 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  29.2 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  30.84 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  26.54 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  28.33 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  26.49 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  26.73 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  30.07 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  28 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  25.37 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  26.28 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.28 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  30.63 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  27.05 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  25.11 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  23.5 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  25.12 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  28.22 
 
 
535 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2269  serine/threonine transporter SstT  26.32 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.538019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  24.6 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  27.15 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  24.95 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  25.68 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  24.35 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1605  serine/threonine transporter SstT  26.07 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  26.48 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  24.25 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  27.25 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.25 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.25 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  31.8 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  24.25 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.275466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>