More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1201 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
391 aa  766    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  59.52 
 
 
401 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  59.49 
 
 
409 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  63.85 
 
 
387 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  56.96 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  64.19 
 
 
387 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  39.06 
 
 
399 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.44 
 
 
406 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  36.32 
 
 
393 aa  236  4e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  36.98 
 
 
392 aa  236  6e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  38.25 
 
 
401 aa  233  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 
400 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  35.9 
 
 
413 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  34.2 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  33.67 
 
 
408 aa  209  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.92 
 
 
367 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  32.49 
 
 
404 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.7 
 
 
432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  32.81 
 
 
433 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  29.72 
 
 
400 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  32.58 
 
 
412 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  27.99 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  29.92 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  30.2 
 
 
409 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  27.51 
 
 
435 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  27.51 
 
 
440 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  27.51 
 
 
440 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  27.59 
 
 
443 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  25.85 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  32.37 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  28.46 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  27.64 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  27.64 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  26.34 
 
 
411 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  27.87 
 
 
411 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  27.87 
 
 
411 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.87 
 
 
411 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  27.87 
 
 
411 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  27.91 
 
 
419 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  26.34 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.87 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  24.5 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  27.35 
 
 
1347 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  24.14 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  26.84 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  23.97 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  34.62 
 
 
470 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  26.18 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  28.4 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  26.84 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  26.84 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  28.52 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  25.75 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.35 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  26.77 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  26.52 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  25.94 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  26.96 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  22.66 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  24.55 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  30.23 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.32 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  25.06 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  24.5 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  27.5 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  29.46 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  28.67 
 
 
451 aa  77  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  26.58 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  25 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.94 
 
 
437 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.35 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  27.16 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  27.76 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  27.12 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  27.93 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  33.77 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  25.81 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  30.37 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  27.12 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  27.39 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  24.38 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0449  Sodium:dicarboxylate symporter  28.04 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  26.96 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  25.92 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  26.69 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  29.94 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  28.97 
 
 
452 aa  72.8  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0702  serine/threonine transporter SstT  24.6 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  23.11 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  25.38 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0112  sodium:dicarboxylate symporter  26.88 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000289227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.36 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  25.25 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.36 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  34.04 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  26.55 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  28.11 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  25.53 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.36 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  29.38 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>