More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1183 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  98.61 
 
 		 406 aa  697    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 		 367 aa  713    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  49.59 
 
 		 399 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  48.77 
 
 		 393 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  49.11 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  43.41 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  45.21 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  43.17 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  43.68 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  40.16 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  45.18 
 
 		 432 aa  262  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  40.55 
 
 		 433 aa  239  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  43.9 
 
 		 412 aa  236  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  36.56 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  37.37 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  34.71 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  35.46 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  33.92 
 
 		 391 aa  209  7e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  34.74 
 
 		 409 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.71 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.2 
 
 		 387 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  26.85 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  31.1 
 
 		 1347 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  36.46 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  28.85 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  25.53 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  28.31 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  26.39 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  26.46 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  24.27 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  38.26 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  26.76 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  27.71 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  30.17 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  31.22 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.72 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  25.56 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  28.87 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  26.74 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  26.75 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  26.59 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.15 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_002978  WD0229  sodium/glutamate symporter family protein, putative  25.92 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.909208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  33.03 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  36.79 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  29.52 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  26.38 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  27.97 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  27.47 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  25.86 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  25.21 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  27.22 
 
 		 434 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  29.17 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  33.33 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.04 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.15 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  25.32 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.13 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.86 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  27.62 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  27.86 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  28.22 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  27.05 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  27.57 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0327  serine/threonine transporter SstT  35.19 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1091  serine/threonine transporter SstT  25.89 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  25.86 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25.54 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0720  serine/threonine transporter SstT  33.33 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  29.14 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  26.28 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  30.17 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  27.15 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.24 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  25.78 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  26.9 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  26.97 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  36.11 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  26.15 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  31.33 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  28.97 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.13 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  27.2 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  30.29 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  27.25 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1070  regulatory protein, ArsR  27.48 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.802527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  29.89 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2525  serine/threonine transporter SstT  29.7 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.114081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2707  serine/threonine transporter SstT  28.92 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  27.78 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4319  serine/threonine transporter SstT  28.37 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  35.19 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  36.36 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4033  serine/threonine transporter SstT  27.5 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161569  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  27.62 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  27.54 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>