More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1461 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 404 aa  805    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  57.5 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  52.87 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  45.45 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  42.97 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  43.75 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  41.1 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  40.36 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  39.74 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  39.19 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.19 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  38.35 
 
 		 432 aa  242  7e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.66 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  34.09 
 
 		 409 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  32.75 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  31.03 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  32.49 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.51 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.98 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  26.99 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  25.98 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  24.55 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  31.7 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  26.1 
 
 		 1347 aa  84  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  26.89 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  27.23 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  27.23 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.35 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3183  serine/threonine transporter SstT  29.37 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  26.18 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3530  serine/threonine transporter SstT  30.47 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.101717 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1091  serine/threonine transporter SstT  28.62 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.71 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  26.14 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2443  serine/threonine transporter SstT  30.47 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  27.36 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3251  serine/threonine transporter SstT  30.47 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529789  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  26.09 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  24.03 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  28.36 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  27.91 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  30.85 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  31.61 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  26.52 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  27.53 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  27.02 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  30.27 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  25.96 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  25.26 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4319  serine/threonine transporter SstT  31.08 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  26.46 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  25.38 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  24.45 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  25.87 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  25.87 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0449  Sodium:dicarboxylate symporter  23.68 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4033  serine/threonine transporter SstT  25.25 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161569  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  26.62 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  26.23 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  26.1 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  23.72 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.34 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  25.06 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1070  regulatory protein, ArsR  32.11 
 
 		 535 aa  70.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.802527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.47 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  26.23 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  30.09 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  26.23 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2269  serine/threonine transporter SstT  26.6 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.538019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  27.82 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  22.47 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  23.77 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2525  serine/threonine transporter SstT  29.84 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.114081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  31.87 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0528  serine/threonine transporter SstT  24.42 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276572  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.89 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  24.73 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  26.89 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2859  serine/threonine transporter SstT  24.11 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00461767  normal  0.0591164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0917  hypothetical protein  23.44 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  28.06 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  24.75 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  27.82 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  23.94 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.21 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  30.81 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  29.51 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0947  hypothetical protein  23.3 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0504  serine/threonine transporter SstT  24.48 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  24.94 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  33.52 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  27.56 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  27.58 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1605  serine/threonine transporter SstT  26.34 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  23.51 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  24.82 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0720  serine/threonine transporter SstT  27.6 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>