266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1230 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
397 aa  782    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  56.25 
 
 
409 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  56.96 
 
 
391 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  59.79 
 
 
387 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  52.41 
 
 
401 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  60.05 
 
 
387 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  40.42 
 
 
399 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  38.4 
 
 
393 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  40.71 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.82 
 
 
406 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  37.4 
 
 
392 aa  238  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  36.87 
 
 
401 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  34.43 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  38.32 
 
 
413 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  32.75 
 
 
404 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.04 
 
 
367 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  31.61 
 
 
408 aa  196  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  30.83 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.53 
 
 
432 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  33.33 
 
 
433 aa  173  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  34.17 
 
 
412 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  26.96 
 
 
381 aa  89.7  8e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  26.95 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  24.62 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  28.63 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  24.47 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  26.29 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  25.81 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  27.44 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  27.62 
 
 
1347 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.74 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  25.92 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  25.4 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  25.12 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  26.59 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  25.87 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  25.18 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  26.02 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  24.13 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.12 
 
 
437 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  26.22 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  25.76 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02342  proton glutamate symport protein  27.2 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  27.89 
 
 
535 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  29.79 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  30.62 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  25.14 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  25.48 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  26.05 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  26.05 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.01 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  27.99 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.01 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  27.56 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  26.05 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  25.61 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0909  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  25.1 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  23.69 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.01 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  25.24 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  22.61 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1033  proton glutamate symport protein  27.31 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.207746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  25.81 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  26.29 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  23.98 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  23.23 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  23.98 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  25.68 
 
 
449 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  32.77 
 
 
432 aa  67  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  30.14 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  24.6 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  23.98 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  23.98 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  23.98 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.25 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  23.98 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  23.98 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1330  sodium:dicarboxylate symporter  28.12 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  26.02 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  24.6 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  27.1 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  23.6 
 
 
441 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  26.05 
 
 
452 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0449  Sodium:dicarboxylate symporter  27.39 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  25.39 
 
 
440 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  31.85 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  28.76 
 
 
433 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  26.02 
 
 
451 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2261  sodium:dicarboxylate symporter  28.48 
 
 
488 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  24.88 
 
 
416 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.14 
 
 
409 aa  63.2  0.000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  23.69 
 
 
430 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  26.74 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>