More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0909 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  75.76 
 
 
439 aa  636    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1033  proton glutamate symport protein  98.38 
 
 
432 aa  852    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.207746  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0909  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
432 aa  863    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02342  proton glutamate symport protein  79.17 
 
 
409 aa  627  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  60.19 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  47.03 
 
 
424 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  47.03 
 
 
424 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  47.12 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2861  Sodium/dicarboxylate symporter  46.68 
 
 
424 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0942349  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2261  sodium:dicarboxylate symporter  41.56 
 
 
488 aa  319  7e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  38 
 
 
437 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  36.52 
 
 
409 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  35.85 
 
 
444 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  35.85 
 
 
444 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  35.85 
 
 
444 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  35.85 
 
 
444 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  35.45 
 
 
430 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  35.36 
 
 
437 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  34.15 
 
 
433 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  34.27 
 
 
432 aa  229  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  34.76 
 
 
424 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  33.1 
 
 
433 aa  227  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  34.05 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  34.64 
 
 
435 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  34.64 
 
 
440 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  34.64 
 
 
440 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 
439 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  36.94 
 
 
417 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  33.58 
 
 
434 aa  219  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  30.54 
 
 
481 aa  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  34.29 
 
 
409 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  33.65 
 
 
434 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  33.58 
 
 
449 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  35.14 
 
 
425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  32.37 
 
 
444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  33 
 
 
440 aa  216  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  35.8 
 
 
457 aa  216  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  32.77 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  32.37 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.25 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  33.41 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  34.73 
 
 
411 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  34.73 
 
 
411 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.73 
 
 
411 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  34.73 
 
 
411 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  32.03 
 
 
445 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  34.73 
 
 
411 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  34.73 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.73 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  33.57 
 
 
402 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  34.07 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  32.78 
 
 
436 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.15 
 
 
445 aa  209  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  30.38 
 
 
443 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  34.78 
 
 
457 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  34.45 
 
 
457 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  34.2 
 
 
411 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  30.14 
 
 
443 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.4 
 
 
437 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  33.33 
 
 
427 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  32.63 
 
 
440 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  32.63 
 
 
440 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  30.49 
 
 
425 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 
436 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  33.49 
 
 
452 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  32.78 
 
 
437 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  32.56 
 
 
440 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  31.53 
 
 
442 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  32.24 
 
 
442 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  36.23 
 
 
424 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  32.24 
 
 
442 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  32.63 
 
 
440 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  31.86 
 
 
442 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.79 
 
 
436 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  31.33 
 
 
437 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  31.33 
 
 
437 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  31.33 
 
 
437 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  31.33 
 
 
437 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  33.77 
 
 
437 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  30.82 
 
 
442 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  31.33 
 
 
437 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  31.33 
 
 
437 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  31.33 
 
 
437 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  31.33 
 
 
437 aa  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  32.45 
 
 
423 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  33.09 
 
 
411 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  32.45 
 
 
423 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  32.45 
 
 
423 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  32.45 
 
 
423 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  31.33 
 
 
437 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2408  sodium:dicarboxylate symporter  32.72 
 
 
425 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.557751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2455  sodium:dicarboxylate symporter  32.72 
 
 
425 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  30.4 
 
 
436 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  30.4 
 
 
436 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  30.4 
 
 
436 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  30.4 
 
 
436 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  33.51 
 
 
437 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  30.4 
 
 
436 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.740703 
 
 
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NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  35.36 
 
 
410 aa  202  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  32.19 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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