More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1626 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  99.11 
 
 		 224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  98.21 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  68.78 
 
 		 222 aa  306  1.0000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  65.61 
 
 		 223 aa  295  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  60.36 
 
 		 227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  59.91 
 
 		 226 aa  271  5.000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  60.63 
 
 		 223 aa  266  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  58.65 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  42.04 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  42.6 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  42.36 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  44.91 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.11 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  40.27 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  44.09 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  40.89 
 
 		 377 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  42.33 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.7 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  41.7 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.48 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  42.33 
 
 		 282 aa  171  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  41.44 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  43.75 
 
 		 236 aa  167  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.1 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  44.29 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  40.18 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  40.45 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  41.74 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  41.74 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  40.62 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  41.96 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.82 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  40.09 
 
 		 383 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  40.54 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  40.09 
 
 		 385 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  40.09 
 
 		 383 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  40.54 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  40.54 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  41.04 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  41.74 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  40.44 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  41.92 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  43.28 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  43.28 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  41.44 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  39.64 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  41.3 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  39.64 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  39.64 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  41.18 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  41.18 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  40.36 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  40.62 
 
 		 246 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  39.11 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  42.4 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  42.47 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  39.64 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  42.86 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  42.4 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  40.61 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  41.26 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  40.27 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.15 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  39.64 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.22 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  39.01 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  42.47 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  39.82 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  39.11 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  41.55 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  39.19 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  40.44 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  40.27 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  39.56 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  40.27 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  38.22 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  40.54 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.15 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  40.95 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  41.55 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  42.25 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  41.55 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  44.5 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  41.28 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  35.32 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  41.44 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  41.44 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  42.92 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  45.26 
 
 		 408 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1730  ribonuclease III  45.26 
 
 		 469 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  40.27 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0654  ribonuclease III  46.74 
 
 		 409 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.988138  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  38.57 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  46.74 
 
 		 409 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  45.26 
 
 		 467 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  44.74 
 
 		 428 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  45.26 
 
 		 467 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  46.74 
 
 		 409 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>