More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0260 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
551 aa  1116    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  49.47 
 
 
576 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  48.03 
 
 
590 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  49.12 
 
 
582 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  49.82 
 
 
580 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  49.82 
 
 
580 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.83 
 
 
590 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  48.85 
 
 
579 aa  520  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  48.18 
 
 
594 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  47.34 
 
 
578 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  46.4 
 
 
583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  49.73 
 
 
581 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 
541 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  46.71 
 
 
575 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  49.03 
 
 
576 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  48.68 
 
 
580 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  50.27 
 
 
585 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.74 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  48.74 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
578 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  48.76 
 
 
585 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  48.74 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  46.02 
 
 
582 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  48.74 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  48.74 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  48.32 
 
 
580 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 
578 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
578 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 
578 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  46.48 
 
 
580 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 
578 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 
578 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 
578 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  46.3 
 
 
580 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  42.93 
 
 
583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
579 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  43.19 
 
 
578 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  40.07 
 
 
588 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  39.65 
 
 
593 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  40.45 
 
 
599 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  38.78 
 
 
593 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  40 
 
 
589 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  39.14 
 
 
587 aa  422  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  41.07 
 
 
592 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 
592 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  39.08 
 
 
599 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  41.55 
 
 
617 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  38.93 
 
 
1106 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  38.64 
 
 
512 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  38.15 
 
 
510 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  38.63 
 
 
912 aa  362  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  35.99 
 
 
917 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  36.5 
 
 
913 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  36.5 
 
 
913 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  36.31 
 
 
913 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  36.06 
 
 
651 aa  336  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  36.72 
 
 
932 aa  333  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  35.52 
 
 
930 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  35.42 
 
 
918 aa  330  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  34.97 
 
 
908 aa  329  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  36.6 
 
 
667 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 
930 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  34.61 
 
 
911 aa  321  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  35.66 
 
 
927 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  35.47 
 
 
927 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  35.29 
 
 
925 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 
919 aa  309  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  34.93 
 
 
911 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  34.93 
 
 
911 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  34.93 
 
 
911 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.38 
 
 
914 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  34.93 
 
 
911 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  34.93 
 
 
911 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  34.62 
 
 
921 aa  302  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  34.99 
 
 
901 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  33.75 
 
 
943 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  34.12 
 
 
901 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  34.19 
 
 
911 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  34.38 
 
 
911 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  33.7 
 
 
916 aa  293  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  34.38 
 
 
911 aa  293  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  33.94 
 
 
901 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  34.19 
 
 
911 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  34.25 
 
 
913 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  34.6 
 
 
933 aa  290  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  34 
 
 
920 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  33.03 
 
 
930 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  32.79 
 
 
912 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  32.25 
 
 
901 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  33.27 
 
 
918 aa  280  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  32.73 
 
 
914 aa  279  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  32.85 
 
 
924 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  32.73 
 
 
994 aa  276  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  32.91 
 
 
927 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  32.97 
 
 
906 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  32.42 
 
 
906 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.79 
 
 
906 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  32.06 
 
 
928 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>