More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2080 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  100 
 
 
144 aa  290  6e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  99.31 
 
 
144 aa  287  3e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  39.16 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  39.16 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  44.59 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  43.92 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
149 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  39.58 
 
 
146 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  39.72 
 
 
151 aa  103  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  36.99 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  40.85 
 
 
143 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  40.85 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  38.36 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  40.56 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  37.06 
 
 
149 aa  90.1  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  38.62 
 
 
146 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  34.93 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  32.19 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  32.39 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  32.39 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  32.65 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  30.87 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  32.65 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.23 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.99 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  31.97 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  31.97 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.93 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.37 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  30.61 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.46 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.67 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.67 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.78 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.78 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  30.61 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.88 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.56 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  34.67 
 
 
169 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.1 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.87 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  29.66 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  28.87 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  31.87 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.76 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.53 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  28.35 
 
 
311 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2171  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.14 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.11 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  31.29 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  31.29 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  31.29 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  31.29 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  31.29 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  31.29 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.41 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.51 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>