More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00915 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  66.94 
 
 		 488 aa  701    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  100 
 
 		 488 aa  1000    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  50 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  46.11 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  45.1 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  47.43 
 
 		 490 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  41.54 
 
 		 498 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  38.52 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  39.32 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  38.55 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  39.71 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  39.24 
 
 		 500 aa  382  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  36.8 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  37.42 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  35.56 
 
 		 526 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  32.49 
 
 		 536 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  32.11 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  30.54 
 
 		 552 aa  270  5.9999999999999995e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  32.68 
 
 		 551 aa  266  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  29.38 
 
 		 548 aa  260  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  32.66 
 
 		 502 aa  256  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  32.66 
 
 		 502 aa  256  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  29.17 
 
 		 542 aa  251  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  29.18 
 
 		 492 aa  236  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  26.94 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  28.94 
 
 		 497 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  30.53 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  30.77 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  29.88 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  30.49 
 
 		 492 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  28.39 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.44 
 
 		 507 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  30.04 
 
 		 531 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  28.83 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  29.74 
 
 		 491 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  29.55 
 
 		 512 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  29.19 
 
 		 511 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  27.5 
 
 		 508 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  27.8 
 
 		 508 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  28.34 
 
 		 512 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  26.24 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  28.34 
 
 		 512 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  26.63 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  29.65 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  28.46 
 
 		 537 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  29.51 
 
 		 511 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  29.01 
 
 		 507 aa  199  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.59 
 
 		 505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  28.72 
 
 		 502 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  28.07 
 
 		 453 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  29.1 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  28.37 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  25.62 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  27.45 
 
 		 495 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  23.54 
 
 		 525 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.35 
 
 		 493 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  26.96 
 
 		 498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  25.74 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  27.27 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  27.59 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  25.53 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  27.39 
 
 		 530 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  26.99 
 
 		 504 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  28.4 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  26.57 
 
 		 503 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  25.14 
 
 		 521 aa  173  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  25.11 
 
 		 530 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  26.53 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  23 
 
 		 553 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  25.71 
 
 		 495 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  26.05 
 
 		 504 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  26.18 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  26.24 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  26.24 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  27.12 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  25.52 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  26.97 
 
 		 494 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  26.1 
 
 		 511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  25.31 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  26.63 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  27.8 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 509 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  25.35 
 
 		 494 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  24.26 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  24.79 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  25.64 
 
 		 495 aa  160  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  26.22 
 
 		 512 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  26.22 
 
 		 512 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  23.83 
 
 		 519 aa  159  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  26.1 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  26.68 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  25.05 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  26.33 
 
 		 492 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  25.09 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  25.4 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  24.59 
 
 		 518 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  25.51 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  23.99 
 
 		 503 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  24.39 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  24.65 
 
 		 502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>