More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0581 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  67.68 
 
 
396 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  52.64 
 
 
394 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  45.64 
 
 
397 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  47.04 
 
 
548 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  46.17 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  46.27 
 
 
550 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  46.27 
 
 
550 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  46.27 
 
 
550 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  46.53 
 
 
548 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  46.06 
 
 
453 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  46.17 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  42.35 
 
 
541 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  43.61 
 
 
396 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  38.92 
 
 
388 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.13 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  35.49 
 
 
390 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  34.95 
 
 
385 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.5 
 
 
390 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.18 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  36.29 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  36.58 
 
 
385 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  36.04 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.74 
 
 
394 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  35.43 
 
 
385 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  37.4 
 
 
390 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.11 
 
 
391 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  34.83 
 
 
383 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  36.03 
 
 
390 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  33.68 
 
 
389 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  32 
 
 
390 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  32.17 
 
 
385 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  33.75 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  32.2 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  33.33 
 
 
385 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  30.37 
 
 
392 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  35.77 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.59 
 
 
386 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  32.06 
 
 
389 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  33.42 
 
 
394 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  35.88 
 
 
403 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  34.39 
 
 
381 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  32.58 
 
 
395 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  32.73 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  35.52 
 
 
402 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  33.08 
 
 
385 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.25 
 
 
389 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  34.1 
 
 
381 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  32.75 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  35.73 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.25 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.4 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  33.01 
 
 
391 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.84 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  32.83 
 
 
385 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  32.83 
 
 
385 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.83 
 
 
389 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
388 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  33.68 
 
 
388 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.66 
 
 
380 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  32.33 
 
 
402 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  33.85 
 
 
384 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  31.98 
 
 
390 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.33 
 
 
389 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.46 
 
 
381 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  32.76 
 
 
388 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  32.5 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.04 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.74 
 
 
390 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  33.33 
 
 
383 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  30.5 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  30.83 
 
 
381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.33 
 
 
382 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.04 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.62 
 
 
390 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.46 
 
 
382 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.2 
 
 
382 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  32.64 
 
 
384 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  32.51 
 
 
388 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  30.75 
 
 
379 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.85 
 
 
397 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  30.71 
 
 
389 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.94 
 
 
382 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  30.23 
 
 
379 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  32.32 
 
 
389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  30.96 
 
 
391 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
387 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  34.76 
 
 
385 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  30.15 
 
 
379 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  32.46 
 
 
382 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  31.23 
 
 
382 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  36.79 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  32.96 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.81 
 
 
388 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.81 
 
 
388 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.81 
 
 
388 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  29.92 
 
 
390 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  31.28 
 
 
379 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  29.09 
 
 
388 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>