More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3904 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3904  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 298 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000111161  normal  0.107896 
 
 
 
NC_008781  Pnap_3458  extracellular solute-binding protein  82.61 
 
 		 299 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4024  extracellular solute-binding protein  76.9 
 
 		 298 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000078041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4073  extracellular solute-binding protein  76.41 
 
 		 300 aa  447  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0828  extracellular solute-binding protein family 3  77.78 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0588  extracellular solute-binding protein family 3  70.9 
 
 		 299 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0609  extracellular solute-binding protein  69.9 
 
 		 299 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.157443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2688  extracellular solute-binding protein  68.12 
 
 		 300 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.606467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1219  extracellular solute-binding protein  70.27 
 
 		 373 aa  414  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1364  extracellular solute-binding protein  69.57 
 
 		 299 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  70.57 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  65.59 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5026  extracellular solute-binding protein family 3  62.91 
 
 		 303 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5673  extracellular solute-binding protein  56.77 
 
 		 299 aa  345  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0691  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  54.18 
 
 		 302 aa  338  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000300559  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0659  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  54.18 
 
 		 302 aa  338  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0658  putative glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein/periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  56.03 
 
 		 460 aa  335  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000641362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0311  extracellular solute-binding protein family 3  53.45 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  55.37 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  53.45 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  48.9 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  50.52 
 
 		 296 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  51.28 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  47.95 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  48.48 
 
 		 298 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  48.48 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  48.48 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  48.48 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  48.57 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  45.55 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  48.16 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  48.21 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  45.42 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  47.12 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  46.98 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  45.76 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.49 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  47.16 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  47.97 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  47.49 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  47.49 
 
 		 297 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  47.49 
 
 		 297 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  47 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  45.45 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  46.45 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  47.16 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 		 299 aa  242  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  46.81 
 
 		 297 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  43.86 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  47.18 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  44.44 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  47.18 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  45.96 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  44.26 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  42.12 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  45.64 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 		 298 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  41.33 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  44.21 
 
 		 306 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  47.04 
 
 		 298 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.16 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  45.16 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  44.21 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  44.21 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  42.71 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  42.41 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  43.28 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  40.66 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  44.48 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  43.52 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  43.24 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  45.93 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  45.93 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  44.53 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  45.79 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  43.66 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  45.93 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  45.93 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  43.19 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  41.36 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  43.27 
 
 		 289 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  43.19 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  41.79 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  41.79 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  43.19 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  43.19 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  41.79 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  41.5 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  45.56 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  44.37 
 
 		 334 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  44.24 
 
 		 319 aa  229  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  42.19 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  45.56 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  39.18 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  43.69 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  45.56 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>