More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3236 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  83.3 
 
 
504 aa  723    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  100 
 
 
480 aa  933    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  70.67 
 
 
493 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  68.12 
 
 
483 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  62.88 
 
 
517 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  62.23 
 
 
517 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  62.88 
 
 
556 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.36 
 
 
491 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.27 
 
 
509 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.71 
 
 
509 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.25 
 
 
502 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  48.19 
 
 
489 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  43.45 
 
 
519 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  42.76 
 
 
502 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.95 
 
 
502 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.23 
 
 
498 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.23 
 
 
498 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.45 
 
 
498 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  42.07 
 
 
502 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.14 
 
 
527 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.92 
 
 
498 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.27 
 
 
514 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.01 
 
 
498 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.92 
 
 
498 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
493 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
514 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
514 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
498 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
498 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
498 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
498 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.38 
 
 
490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.62 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  40.82 
 
 
533 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.27 
 
 
515 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.3 
 
 
502 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  41.59 
 
 
504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.48 
 
 
504 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.7 
 
 
699 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  43.3 
 
 
505 aa  292  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.82 
 
 
515 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.87 
 
 
474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.49 
 
 
702 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.54 
 
 
489 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  38.61 
 
 
490 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  42.51 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.61 
 
 
604 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  35.08 
 
 
496 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  38.05 
 
 
514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.4 
 
 
498 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 
504 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  38.07 
 
 
492 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  39.23 
 
 
615 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.81 
 
 
509 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  35.31 
 
 
496 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  39.23 
 
 
594 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  39.23 
 
 
585 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  39.02 
 
 
593 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  39.02 
 
 
582 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  39.02 
 
 
582 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  39.02 
 
 
576 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.6 
 
 
509 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  39.02 
 
 
601 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.25 
 
 
483 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.66 
 
 
552 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.74 
 
 
482 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.59 
 
 
529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.22 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  37.31 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.02 
 
 
543 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.82 
 
 
515 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.18 
 
 
499 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  37.79 
 
 
498 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.32 
 
 
509 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  38.33 
 
 
484 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.38 
 
 
525 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 
505 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 
505 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.88 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.95 
 
 
494 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3114  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.91 
 
 
475 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.77 
 
 
488 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268118  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.49 
 
 
600 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  33.1 
 
 
606 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.8 
 
 
483 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.248268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.32 
 
 
478 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.32 
 
 
478 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.32 
 
 
478 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.32 
 
 
478 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  32.32 
 
 
478 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.59 
 
 
471 aa  200  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.77 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.33 
 
 
489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.9 
 
 
504 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0905  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  34.11 
 
 
478 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.601202  normal  0.184806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5588  putative outer membrane efflux protein MdtP  31.97 
 
 
488 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.48 
 
 
495 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.91 
 
 
516 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  32.78 
 
 
474 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>