More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2142 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  67.58 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  59.04 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  58.72 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  57.14 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  57.76 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  54.32 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  54.55 
 
 		 336 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  54.13 
 
 		 395 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  56.49 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  55.08 
 
 		 335 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.27 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.58 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.51 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.47 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.1 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.55 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.1 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.45 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  44.52 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  43.48 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.94 
 
 		 333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.09 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  42.02 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.74 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.98 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  44.26 
 
 		 318 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.61 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  45.18 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.59 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  44.59 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  43.96 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  43.05 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  45.15 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.42 
 
 		 355 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.55 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.81 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  42.33 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  43.58 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  46.23 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.46 
 
 		 323 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.24 
 
 		 327 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.83 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  40.92 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.11 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.91 
 
 		 337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  41.05 
 
 		 334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.26 
 
 		 324 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  41.28 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.39 
 
 		 331 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.95 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.49 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  41.39 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.39 
 
 		 343 aa  252  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  40.85 
 
 		 312 aa  251  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  43.05 
 
 		 356 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  41.93 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  43.62 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  47.88 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.94 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  40.56 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  41.69 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.4 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  41.69 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  41.95 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.55 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.55 
 
 		 321 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  41.59 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  43.87 
 
 		 321 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.94 
 
 		 323 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  40.92 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  41.95 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  40.12 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.2 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.53 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.46 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  39.13 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  42.96 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.75 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.26 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  41.61 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.47 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  38.58 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.86 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.48 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  38.55 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  39.88 
 
 		 326 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  40.62 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.67 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.3 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>