49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3943 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  91.54 
 
 		 201 aa  362  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  76.07 
 
 		 234 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  65.29 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  65.29 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  65.29 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  65.7 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  64.88 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  64.88 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  64.88 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  64.63 
 
 		 229 aa  297  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  64.53 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  63.64 
 
 		 231 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  68.47 
 
 		 203 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  65.73 
 
 		 222 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  65.6 
 
 		 224 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  62.93 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  64.81 
 
 		 222 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  34.85 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  37.08 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  37.22 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  36.57 
 
 		 240 aa  98.2  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  32.16 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  28.05 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  36.07 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  36.09 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  31.88 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  36.23 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  32.52 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  34.35 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  34.4 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  31.34 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  30.09 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  28.72 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  28.49 
 
 		 291 aa  52  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  26.01 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  51.79 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.51 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  29.84 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  26.32 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  30.58 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  51.28 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  33.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  33.62 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  31.68 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  28.69 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  40.74 
 
 		 204 aa  42  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  25.84 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>