77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3907 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  100 
 
 		 344 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  51.21 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  50.47 
 
 		 362 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  49.7 
 
 		 340 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  47.09 
 
 		 363 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  49.4 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  48.91 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  48.9 
 
 		 362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  47.59 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  48.19 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  48.19 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  47.89 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  46.69 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.8 
 
 		 765 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  42.27 
 
 		 475 aa  275  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  33.11 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  29.08 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  31.02 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  27.57 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  28.25 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  25.5 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  26.72 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  25 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.14 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.14 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.14 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.01 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  23.1 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  26.42 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  27.98 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.22 
 
 		 361 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  26.01 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  25.21 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  21.86 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  23.55 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  22.14 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  25.46 
 
 		 486 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  28.16 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  23.23 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  26.48 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  25.32 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1444  fatty acid desaturase  25.3 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  22.5 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1009  putative fatty acid desaturase  44.44 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304323  normal  0.123279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  26.12 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  23.57 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5096  fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4315  fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  hitchhiker  0.0000507708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4996  fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5864  fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3247  fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  24.87 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5636  fatty acid desaturase  31.11 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2975  Fatty acid desaturase  39.29 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  22.92 
 
 		 365 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5711  fatty acid desaturase  27.39 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6001  fatty acid desaturase  31.11 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  23.91 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  22.22 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  22.37 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6492  fatty acid desaturase  31.11 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  20.75 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0878  fatty acid desaturase  23.62 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5242  fatty acid desaturase  48.65 
 
 		 431 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  24.64 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  22.59 
 
 		 358 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>