More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1744 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 424 aa  875    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  75.96 
 
 		 440 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  75.3 
 
 		 446 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  55.87 
 
 		 426 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  55.48 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  55.48 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  55.24 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  57.21 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  57.43 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  56.48 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  51.07 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  53.06 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  50.48 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  53.16 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  55.56 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  55.56 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  55.56 
 
 		 482 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  37.37 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  37.56 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  37.56 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  37.24 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  37.24 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  37.24 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  36.99 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  36.13 
 
 		 419 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  38.35 
 
 		 429 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  37.84 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  37.59 
 
 		 464 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  37.59 
 
 		 515 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  34.66 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  32.26 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  37.18 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  36.11 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  35.73 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  34.61 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  36.82 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  34.86 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  34.86 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  32.92 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  34.96 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  34.96 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  34.96 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  34.96 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  33.68 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  34.7 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  33.68 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.54 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  34.54 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  34.54 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  33.93 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  33.93 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  34.28 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.28 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.28 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  34.34 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.73 
 
 		 790 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.11 
 
 		 780 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  30.36 
 
 		 421 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.87 
 
 		 777 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  29.03 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  24.62 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  29.8 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  34.22 
 
 		 396 aa  136  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.84 
 
 		 584 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  34.98 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  37.28 
 
 		 601 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  37.28 
 
 		 582 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.51 
 
 		 596 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  34.51 
 
 		 592 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.77 
 
 		 572 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  35.09 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  34.65 
 
 		 379 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  34.21 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  30.17 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.28 
 
 		 590 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  31.78 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.89 
 
 		 580 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  35.24 
 
 		 590 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  31.97 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.92 
 
 		 581 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  34.8 
 
 		 590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.56 
 
 		 594 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.56 
 
 		 594 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  31.7 
 
 		 272 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.93 
 
 		 605 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 584 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.94 
 
 		 585 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.36 
 
 		 584 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.16 
 
 		 800 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.94 
 
 		 585 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.94 
 
 		 585 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  30.36 
 
 		 584 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.36 
 
 		 583 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.36 
 
 		 584 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.36 
 
 		 583 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.94 
 
 		 585 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  34.08 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  31.23 
 
 		 272 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>