More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0649 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
496 aa  1003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
496 aa  1003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  67.76 
 
 
486 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  57.7 
 
 
496 aa  518  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  54.03 
 
 
504 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  55.02 
 
 
496 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  55.43 
 
 
477 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  56.25 
 
 
472 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  52.94 
 
 
486 aa  469  1e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  51.27 
 
 
461 aa  453  1e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.74 
 
 
482 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.68 
 
 
464 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.44 
 
 
489 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.93 
 
 
504 aa  337  3e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.39 
 
 
477 aa  327  4e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1456  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.46 
 
 
480 aa  312  7e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  8.57275e-05 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0690  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.37 
 
 
474 aa  308  2e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.73 
 
 
531 aa  305  1e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 
459 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.17 
 
 
485 aa  299  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.18 
 
 
481 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.92967e-07 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.57 
 
 
478 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  39.18 
 
 
485 aa  296  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  38.88 
 
 
485 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  38.6 
 
 
499 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  7.07781e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.96 
 
 
486 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.84 
 
 
472 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  40.98 
 
 
492 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.2 
 
 
482 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.05 
 
 
486 aa  287  3e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  38.26 
 
 
486 aa  283  7e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1686  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  39.45 
 
 
516 aa  282  8e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108559  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.31 
 
 
470 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.77 
 
 
495 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.87 
 
 
484 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.69 
 
 
473 aa  276  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  1.88172e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.45 
 
 
489 aa  275  1e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.16 
 
 
488 aa  275  2e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.39 
 
 
484 aa  275  2e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.14 
 
 
459 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.39 
 
 
484 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.39 
 
 
484 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  38.83 
 
 
491 aa  273  5e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.88 
 
 
474 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.2 
 
 
496 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.99 
 
 
505 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.99 
 
 
495 aa  271  3e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.04 
 
 
480 aa  270  6e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2254  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.34 
 
 
487 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.65 
 
 
481 aa  269  9e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.34 
 
 
493 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.53 
 
 
515 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.75 
 
 
500 aa  267  3e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  33.92 
 
 
501 aa  267  3e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.66 
 
 
460 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.67 
 
 
517 aa  266  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.58 
 
 
477 aa  266  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.05 
 
 
471 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.98 
 
 
497 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.48 
 
 
486 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.17 
 
 
489 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  37.73 
 
 
491 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.78 
 
 
501 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.09 
 
 
469 aa  263  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  37.65 
 
 
512 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2194  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.08 
 
 
518 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0247365  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.01 
 
 
514 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.18 
 
 
521 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.23 
 
 
460 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.21 
 
 
475 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.62 
 
 
517 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  36.23 
 
 
460 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.66 
 
 
525 aa  260  5e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.92 
 
 
514 aa  260  5e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  36.14 
 
 
470 aa  259  5e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.42 
 
 
493 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 
516 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  32.05 
 
 
495 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.81 
 
 
491 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  37.67 
 
 
509 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.15 
 
 
507 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.56 
 
 
480 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.36 
 
 
499 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  35.7 
 
 
457 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.66732e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.09 
 
 
457 aa  256  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  35.7 
 
 
457 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.97 
 
 
499 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  35.7 
 
 
457 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  35.7 
 
 
457 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.82 
 
 
485 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  33.9 
 
 
457 aa  256  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  4.4393e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.16 
 
 
544 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.84 
 
 
470 aa  256  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.45 
 
 
474 aa  255  1e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.68 
 
 
485 aa  255  1e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.96 
 
 
510 aa  255  1e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  36.71 
 
 
514 aa  255  2e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.15 
 
 
507 aa  254  2e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.39 
 
 
474 aa  254  2e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.05 
 
 
476 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>