More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4327 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4160  porin  82.76 
 
 
405 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  86 
 
 
406 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  85.96 
 
 
404 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  86 
 
 
406 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  82.76 
 
 
405 aa  634    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  86 
 
 
406 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  100 
 
 
399 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  75.37 
 
 
400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  75.12 
 
 
400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  75.62 
 
 
400 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  75.37 
 
 
400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  74.88 
 
 
400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  70.5 
 
 
406 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  68.49 
 
 
399 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  68.98 
 
 
399 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  63.55 
 
 
405 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  65.45 
 
 
405 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  64.66 
 
 
405 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  63.18 
 
 
406 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  62.02 
 
 
411 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  61.54 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  61.33 
 
 
405 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  61.92 
 
 
406 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  66.48 
 
 
409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  48.95 
 
 
395 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  48.95 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  48.68 
 
 
395 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  48.16 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  49.44 
 
 
398 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  48.54 
 
 
398 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  46.42 
 
 
394 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  44.04 
 
 
397 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  43.87 
 
 
421 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  43.87 
 
 
421 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  43.87 
 
 
397 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  45.11 
 
 
411 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  45.08 
 
 
445 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.14 
 
 
397 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  43.31 
 
 
397 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  44.97 
 
 
402 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.92 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  42.68 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  44.44 
 
 
394 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  42.68 
 
 
399 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  42.68 
 
 
399 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  42.68 
 
 
399 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  42.68 
 
 
399 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  42.29 
 
 
391 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.65 
 
 
389 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  40.05 
 
 
436 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  40.05 
 
 
436 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.8 
 
 
386 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.8 
 
 
386 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.8 
 
 
386 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.8 
 
 
386 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.8 
 
 
386 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.21 
 
 
383 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.55 
 
 
386 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.6 
 
 
383 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.2 
 
 
383 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.2 
 
 
383 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.5 
 
 
385 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.25 
 
 
385 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  42.52 
 
 
390 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  41.73 
 
 
390 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  41.23 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  40.1 
 
 
393 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  40.26 
 
 
393 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  40.1 
 
 
387 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  36.89 
 
 
389 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  38.7 
 
 
389 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  38.42 
 
 
390 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  40.3 
 
 
386 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  40.3 
 
 
386 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  41.94 
 
 
386 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  41.47 
 
 
390 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  39.85 
 
 
386 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  40.3 
 
 
386 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  41.83 
 
 
385 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  38.7 
 
 
389 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  39.6 
 
 
386 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  39.95 
 
 
430 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  39.6 
 
 
386 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  41.83 
 
 
523 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  40.68 
 
 
390 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  39.7 
 
 
430 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  39.7 
 
 
430 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  39.45 
 
 
390 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  41.27 
 
 
390 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  41.27 
 
 
390 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  39.45 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  39.45 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  39.45 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  40.55 
 
 
411 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  41.44 
 
 
385 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  40.55 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  40.55 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  40.55 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  40.69 
 
 
430 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  40.69 
 
 
430 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>